RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W ERP4Q12450 207 aa2.72□□□□□ -1.97
NTF2YER009W TRP1P00912 224 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W IMA3P0CW40 589 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W IMA4P0CW41 589 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RAD57P25301 460 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W SWH1P35845 1188 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W HEL1P36113 551 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W BTN2P53286 410 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W MTM1P53320 366 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W MDG1P53885 366 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W CIK1Q01649 594 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W URH1Q04179 340 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W IMA2Q08295 589 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W UAF30Q08747 228 aa2.71□□□□□ -1.98
NTF2YER009W SUP35P05453 685 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W DAL2P25335 343 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W MNS1P32906 549 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W LTV1P34078 463 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W YBR056WP38081 501 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W GAT2P40209 560 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W YPS6P40583 537 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data2.7□□□□□ -1.98not detected
NTF2YER009W SFH5P47008 294 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RSC1P53236 928 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RHO5P53879 331 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W BCH1Q05029 724 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W YLR456WQ06199 204 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W DCI1Q08558 271 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W GPM3Q12326 303 aa2.7□□□□□ -1.98
NTF2YER009W CYC3P06182 269 aa2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W PET123P17558 318 aa2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W SDS24P38314 527 aa2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W MSG5P38590 489 aa2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W JLP2P40206 208 aa2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W PAN6P40459 309 aa2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W GYL1Q04322 720 aa2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
NTF2YER009W NFT1P0CE68 1218 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W REV1P12689 985 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W CLN3P13365 580 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RIM1P32445 135 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W CYS4P32582 507 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W SWD3P38123 315 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W FAD1P38913 306 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W STN1P38960 494 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W STD1Q02794 444 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W MMT1Q03218 510 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RUP1Q12242 671 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W YRM1Q12340 786 aa2.68□□□□□ -1.98
NTF2YER009W ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W YCL068CP25593 260 aa2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W POP5P28005 173 aa2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W KAR9P32526 644 aa2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W YEL045CP32616 141 aa2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W CHK1P38147 527 aa2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W LRP1P38801 184 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W PIB2P53191 635 aa2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W HRT3Q12347 344 aa2.67□□□□□ -1.98
NTF2YER009W ALG1P16661 449 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W HSP104P31539 908 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W ATP3P38077 311 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W STP2P38704 541 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W INM1P38710 295 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W SIM1P40472 476 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W CHS6P40955 746 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W LCB2P40970 561 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W BRO1P48582 844 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W VPS9P54787 451 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W CCE1Q03702 353 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W RAX1Q08760 435 aa2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
NTF2YER009W PDE2P06776 526 aa2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W CDC21P06785 304 aa2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W DST1P07273 309 aa2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W MNE1P24720 663 aa2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W LDB16P25587 256 aa2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W PEX5P35056 612 aa2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W SBE22P38814 852 aa2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W GPI16P38875 610 aa2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W PRE5P40302 234 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W SHE10P53075 577 aa2.65□□□□□ -1.99
NTF2YER009W SDT1P53078 280 aa2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.2 ms