RNA–Protein interactions for RNA: YCL050C

APA1, Transcript of AP4A phosphorylase, yeast

Gene APA1, Length 966 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APA1	YCL050C	YBR056W	P38081	501 aa		3.41	□□□□□ -1.86
APA1	YCL050C	YAL037W	P39728	267 aa		3.41	□□□□□ -1.86
APA1	YCL050C	BSC6	Q08280	497 aa		3.41	□□□□□ -1.86
APA1	YCL050C	FDH1	Q08911	376 aa		3.41	□□□□□ -1.86
APA1	YCL050C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	JLP2	P40206	208 aa		3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	SFH5	P47008	294 aa		3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	MDE1	P47095	244 aa		3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	MTQ1	P53944	314 aa		3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	SPC19	Q03954	165 aa		3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	DCS1	Q06151	350 aa		3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	NDE2	Q07500	545 aa		3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	BUG1	Q12191	341 aa		3.4	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	RAD57	P25301	460 aa		3.39	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	GEX1	P25596	615 aa		3.39	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	KAR9	P32526	644 aa		3.39	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	YHR131C	P38835	850 aa		3.39	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	ADA2	Q02336	434 aa		3.39	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	NUP116	Q02630	1113 aa		3.39	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	MED2	Q12124	431 aa		3.39	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	PCL1	P24867	279 aa		3.38	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	CSE2	P33308	149 aa		3.38	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	YIL029C	P40538	142 aa		3.38	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	HAL1	Q01766	294 aa		3.38	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	ACL4	Q03771	387 aa		3.38	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	SRL2	Q12020	392 aa		3.38	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	ATG34	Q12292	412 aa		3.38	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	ISN1	Q99312	450 aa		3.38	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	UTH1	P36135	365 aa		3.37	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	CHK1	P38147	527 aa		3.37	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	BRO1	P48582	844 aa		3.37	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	OCA2	P53949	197 aa		3.37	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	HOT1	Q03213	719 aa		3.37	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	YCL068C	P25593	260 aa		3.36	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	ADK2	P26364	225 aa		3.36	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	COX14	P39103	70 aa		3.36	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	VPS54	Q12071	889 aa		3.36	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	CCE1	Q03702	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	IZH2	Q12442	317 aa		3.35	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	NUP2	P32499	720 aa		3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	SLM4	P38247	162 aa		3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	GAB1	P41733	394 aa		3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	URH1	Q04179	340 aa		3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	MMR1	Q06324	491 aa		3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	RAX1	Q08760	435 aa		3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	MTR10	Q99189	972 aa		3.34	□□□□□ -1.87
APA1	YCL050C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	PDX1	P16451	410 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	CLB1	P24868	471 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	ERV1	P27882	189 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	SBE22	P38814	852 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	ALF1	P53904	254 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	STD1	Q02794	444 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	MMT1	Q03218	510 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	IMA2	Q08295	589 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	JID1	Q12350	301 aa		3.33	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	RPC53	P25441	422 aa		3.32	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	DBF4	P32325	704 aa		3.32	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	YFR057W	P43625	151 aa		3.32	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	MRM2	P53123	320 aa		3.32	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	RMT2	Q03305	412 aa		3.32	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	PLP2	Q12017	286 aa		3.32	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	ISA2	Q12425	185 aa		3.32	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	RTC2	P38279	296 aa		3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	MIG3	P39943	394 aa		3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	DFG10	P40526	253 aa		3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	ZIM17	P42844	174 aa		3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	BIR1	P47134	954 aa		3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	RIF2	Q06208	395 aa		3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	AEP3	Q12089	606 aa		3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	NCA2	Q12374	616 aa		3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	AHC1	Q12433	566 aa		3.31	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	MSI1	P13712	422 aa		3.3	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.3	□□□□□ -1.88	not detected
APA1	YCL050C	HEL1	P36113	551 aa		3.3	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
APA1	YCL050C	GAT2	P40209	560 aa		3.3	□□□□□ -1.88

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