RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	STAM	Q92783	540 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	GMCL1	Q96IK5	515 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	SIX2	Q9NPC8	291 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	SCP2	P22307	547 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	ATP2B2	Q01814	1243 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	BRD3	Q15059	726 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	BATF3	Q9NR55	127 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	LIG3	P49916	1009 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	JAM2	P57087	298 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	TBCK	Q8TEA7	893 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	GPR88	Q9GZN0	384 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC151	A5D8V7	595 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	TDP2	O95551	362 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	STIM1	Q13586	685 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	RINL	Q6ZS11	566 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	CARD6	Q9BX69	1037 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	SPAG1	Q07617	926 aa		12.02	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	GOLGA1	Q92805	767 aa		12.02	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	RPTOR	Q8N122	1335 aa		12.02	□□□□□ -0.48
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC189	A1A4V9	331 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	AGPS	O00116	658 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	C21orf2	O43822	256 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC175	P0C221	793 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	SLURP2	P0DP57	97 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	NFIA	Q12857	509 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC38	Q502W7	563 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	NYAP2	Q9P242	653 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PLA2G6	O60733	806 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	APBA3	O96018	575 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PPFIA2	O75334	1257 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	STK32B	Q9NY57	414 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PCNT	O95613	3336 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	SMCO2	A6NFE2	343 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PPP1R37	O75864	691 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	HLA-DOA	P06340	250 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	STX17	P56962	302 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49	5e-7	■■■□□ 17.1
ILF3-208	ENST00000587928	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	RUBCN	Q92622	972 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	RUFY1	Q96T51	708 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	SH3GL2	Q99962	352 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	CABP7	Q86V35	215 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	SLC35F6	Q8N357	371 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	ECHS1	P30084	290 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	UBA7	P41226	1012 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PPP1R2	P41236	205 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	DNM2	P50570	870 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	ZBED6	P86452	979 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	SEPT2	Q15019	361 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	ANO9	A1A5B4	782 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	KCNA3	P22001	575 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	TCEAL1	Q15170	157 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	IQCD	Q96DY2	449 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		12	□□□□□ -0.49
ILF3-208	ENST00000587928	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms