RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 MYO1EQ12965 1108 aa14.83□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CUL4BQ13620 913 aa14.83□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 C19orf81C9J6K1 198 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CTDNEP1O95476 244 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ELF1P32519 619 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 MAN2A1Q16706 1144 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 OTUD5Q96G74 571 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 NT5C1BQ96P26 610 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 MMP19Q99542 508 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 THAP9Q9H5L6 903 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 NDUFAB1O14561 156 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 MFAP3P55082 362 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 PSMD2Q13200 908 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CCDC6Q16204 474 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 NEK9Q8TD19 979 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ACAD9Q9H845 621 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 USTQ9Y2C2 406 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 GIPC1O14908 333 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ENTPD3O75355 529 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CASP1P29466 404 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CHRNA5P30532 468 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 TKFCQ3LXA3 575 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 LGSNQ5TDP6 509 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 IFT20Q8IY31 132 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 FAM196BA6NMK8 535 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 TRIM11Q96F44 468 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 EFCC1Q9HA90 598 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.82□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 MEIS1O00470 390 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 KRT76Q01546 638 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 GDAQ9Y2T3 454 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 IFT172Q9UG01 1749 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 PLA2G4BP0C869 781 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 KRT10P13645 584 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 PTK2Q05397 1052 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 SREBF2Q12772 1141 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 KRT81Q14533 505 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 RAET1EQ8TD07 263 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 MTFR1LQ9H019 292 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 RNF146Q9NTX7 359 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 GINM1Q9NU53 330 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 SPP2Q13103 211 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 SNAPC2Q13487 334 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 SENP2Q9HC62 589 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.81□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 TNFAIP2Q03169 654 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ARID5BQ14865 1188 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 PPP2R5EQ16537 467 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 MTERF2Q49AM1 385 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 RAB20Q9NX57 234 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CRCPO75575 148 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 SNAP25P60880 206 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ITIH3Q06033 890 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 KRT31Q15323 416 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 RMDN3Q96TC7 470 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 RNF8O76064 485 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ANXA13P27216 316 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ECE1P42892 770 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 Q3C1V9 767 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CCDC25Q86WR0 208 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 SFNP31947 248 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ARHGAP25P42331 645 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 CFAP157Q5JU67 520 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 FBF1Q8TES7 1133 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 NWD1Q149M9 1564 aa14.8□□□□□ -0.04
NISCH-207ENST00000479054 TLDC2A0PJX2 215 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms