RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 NECTIN1Q15223 517 aa23.3■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.3■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 FANCBQ8NB91 859 aa23.3■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.3■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 APBB2Q92870 758 aa23.3■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 ADAM17P78536 824 aa23.29■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 RNF20Q5VTR2 975 aa23.29■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.29■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.29■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.29■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 TOP1MTQ969P6 601 aa23.29■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.29■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.29■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 MAFGO15525 162 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 ATP9AO75110 1047 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 KCNA2P16389 499 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 MTMR1Q13613 665 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 FAM26DQ5JW98 314 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 SAMD11Q96NU1 681 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 YME1L1Q96TA2 773 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.28■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 ITGB5P18084 799 aa23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 UBE2SQ16763 222 aa23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 MICU3Q86XE3 530 aa23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.27■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 UPP2O95045 317 aa23.26■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 COL9A1P20849 921 aa23.26■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 PPFIA1Q13136 1202 aa23.26■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 RPAINQ86UA6 219 aa23.26■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 RSPH3Q86UC2 560 aa23.26■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 GLG1Q92896 1179 aa23.26■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.26■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 JADE2Q9NQC1 790 aa23.26■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.25■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.25■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 PTPROQ16827 1216 aa23.25■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.25■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 EPC2Q52LR7 807 aa23.24■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.24■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23.24■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.24■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.24■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.24■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 CHRNA1P02708 482 aa23.23■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 MARK3P27448 753 aa23.23■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 GRIK4Q16099 956 aa23.23■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.23■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 NEK1Q96PY6 1258 aa23.23■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 APOA5Q6Q788 366 aa23.22■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.22■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 GHRP10912 638 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 NAPAP54920 295 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 RTN1Q16799 776 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 TMEM192Q8IY95 271 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 IL17RAQ96F46 866 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 AZI2Q9H6S1 392 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 COL4A6Q14031 1691 aa23.21■■□□□ 1.31
ELL3-202ENST00000433927 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.2■■□□□ 1.3
ELL3-202ENST00000433927 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.2■■□□□ 1.3
ELL3-202ENST00000433927 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ELL3-202ENST00000433927 H3BNC9 293 aa23.2■■□□□ 1.3
ELL3-202ENST00000433927 ZBTB43O43298 467 aa23.2■■□□□ 1.3
ELL3-202ENST00000433927 MGAT3Q09327 533 aa23.2■■□□□ 1.3
ELL3-202ENST00000433927 GPM6BQ13491 265 aa23.2■■□□□ 1.3
ELL3-202ENST00000433927 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.2■■□□□ 1.3
ELL3-202ENST00000433927 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.2■■□□□ 1.3
ELL3-202ENST00000433927 SDF4Q9BRK5 362 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms