RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W ZIM17P42844 174 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W GPI8P49018 411 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W CWC24P53769 259 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RRN5Q02983 363 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RAD30Q04049 632 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PUN1Q06991 263 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RRT8Q08219 342 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W REX4Q08237 289 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MCA1Q08601 432 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YLR111WQ12528 110 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W COX3P00420 269 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W KSS1P14681 368 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W TAL1P15019 335 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W GRR1P24814 1151 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YCL049CP25577 312 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RPL5P26321 297 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SSE2P32590 693 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SSO1P32867 290 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MRPL6P32904 214 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SFC1P33303 322 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PIM1P36775 1133 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W WSC4P38739 605 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YAL037WP39728 267 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W TIF34P40217 347 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MPM1P40364 252 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PDR8Q06149 701 aa8.93□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W STE7P06784 515 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W TYR1P20049 452 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W CNA1P23287 553 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PPH21P23594 369 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SRX1P36077 127 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W APT2P36973 181 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ASC1P38011 319 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MNN2P38069 597 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SCO2P38072 301 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MTG2P38860 518 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PLB1P39105 664 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W VRG4P40107 337 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W FAR7P43592 221 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ARE2P53629 642 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W OAZ1Q02803 292 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ENT2Q05785 613 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W TEN1Q07921 160 aa8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RED1P14291 827 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W FUR1P18562 216 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W LHS1P36016 881 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MUM2P38236 366 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YHR033WP38690 423 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PAC10P48363 199 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RAD17P48581 401 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MNN10P50108 393 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W NIS1P53939 407 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YLR036CQ07986 203 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YPR022CQ12139 1133 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YPR064WQ12492 139 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RIB3Q99258 208 aa8.91□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YMR084WA2P2R3 262 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MER1P16523 270 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ERG1P32476 496 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ECM8P38246 354 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YHR177WP38867 453 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YAR028WP39548 234 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PTC2P39966 464 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YJL049WP47048 450 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SWP1Q02795 286 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MSC1Q03104 513 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YDR179W-AQ03983 463 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SMP3Q04174 516 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SPO77Q06134 477 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W XYL2Q07993 356 aa8.9□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PUT2P07275 575 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W CDC4P07834 779 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W CBS2P14905 389 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W URE2P23202 354 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W BUB3P26449 341 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W DOM34P33309 386 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W HCS1P34243 683 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W BNA4P38169 460 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W ATG14P38270 344 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W YHR112CP38716 378 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W QDR2P40474 542 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W MSS2P40990 351 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W ROG1P53118 685 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W SWS2P53937 143 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W YDR444WQ04093 687 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W YFT2Q06676 274 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W SWA2Q06677 668 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W PUS9Q12069 462 aa8.89□□□□□ -0.99
BRR1YPR057W TPK3P05986 398 aa8.88□□□□□ -0.99
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