RNA–Protein interactions for RNA: YPL219W

PCL8, Transcript of Cyclin, yeast

Gene PCL8, Length 1,479 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PCL8	YPL219W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	LIF1	P53150	421 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	NMA2	P53204	395 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	STD1	Q02794	444 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	DSE3	Q08729	430 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	ATG31	Q12421	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
PCL8	YPL219W	ALG7	P07286	448 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	COQ1	P18900	473 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	CKA2	P19454	339 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	MGR1	P25573	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YPS1	P32329	569 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	REC114	P32841	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	EFM2	P38347	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	ELO1	P39540	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PHO23	P50947	330 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	ROG1	P53118	685 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RTT103	Q05543	409 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	ARR2	Q06597	130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	POS5	Q06892	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PEX27	Q08580	376 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
PCL8	YPL219W	RUP1	Q12242	671 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RAD3	P06839	778 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	HXT2	P23585	541 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YSP3	P25036	478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PBN1	P25580	416 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	GSY2	P27472	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PPA2	P28239	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	CWP1	P28319	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	CDC5	P32562	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	FRE1	P32791	686 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	HES1	P35843	434 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	LHS1	P36016	881 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	MRPL10	P36520	322 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	DUG2	P38149	878 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	SPC97	P38863	823 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	SPG5	P42933	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	MSY1	P48527	492 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YGL108C	P53139	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	BUD17	P53727	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RNT1	Q02555	471 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	TAF12	Q03761	539 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	CYK3	Q07533	885 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	NSE1	Q07913	336 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RKI1	Q12189	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YAK1	P14680	807 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	ZRC1	P20107	442 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	HCM1	P25364	564 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	CNE1	P27825	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	MIA40	P36046	403 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RSM22	P36056	628 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	APL3	P38065	1025 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	IML3	P38265	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	VHC1	P38329	1120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PCA1	P38360	1216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	CIN4	P39110	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PAC11	P40960	533 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	ATG27	P46989	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YIP4	P53093	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	MRPL50	P53724	139 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	SHR3	Q02774	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	COX20	Q04935	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	SYO1	Q07395	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	PAM18	Q07914	168 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	COX1	P00401	534 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RIP1	P08067	215 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	GAC1	P28006	793 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	ATP7	P30902	174 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
PCL8	YPL219W	EMP70	P32802	667 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	SPT10	P35208	640 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCL8	YPL219W	RTC2	P38279	296 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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