RNA–Protein interactions for RNA: YOR264W

DSE3, Transcript of Daughter cell-specific protein, may help establish daughter fate, yeast

Gene DSE3, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE3	YOR264W	RRN10	P38204	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSE3	YOR264W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	CBS2	P14905	389 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	LSB5	P25369	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	GEX1	P25596	615 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	RGT1	P32862	1170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	PHO86	P46956	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	YNR048W	P53740	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	BOR1	P53838	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	BET5	Q03630	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	SCW10	Q04951	389 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	ESA1	Q08649	445 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	RAD61	Q99359	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	SPS22	P25380	463 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	MIX23	P38162	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	PHB2	P50085	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	ORT1	Q12375	292 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	SLY1	P22213	666 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	KKQ8	P36004	724 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	AVT5	P38176	459 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	NCA3	P46955	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	GPI15	P53961	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	CIK1	Q01649	594 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	TAF12	Q03761	539 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	RRN11	Q04712	507 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	MTR10	Q99189	972 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	HOM3	P10869	527 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	CPR4	P25334	318 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	CTR86	P25355	563 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	ITR1	P30605	584 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	YBL059W	P34224	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	NDT80	P38830	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	MTC6	P38849	526 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	YAL037W	P39728	267 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	YML6	P51998	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	RSC1	P53236	928 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	RSN1	Q03516	953 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	PPM1	Q04081	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	FAA2	P39518	744 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	SER3	P40054	469 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	YGR111W	P53265	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	GYL1	Q04322	720 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	PBA1	Q05778	276 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	AEP3	Q12089	606 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	TLG2	Q08144	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	DCI1	Q08558	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	BUG1	Q12191	341 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	RMD5	Q12508	421 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSE3	YOR264W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
DSE3	YOR264W	HEL1	P36113	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	YBR056W	P38081	501 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	VHS2	P40463	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	YPI1	P43587	155 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	TOM22	P49334	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	TOF1	P53840	1238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	HXT11	P54862	567 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	GPM3	Q12326	303 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	SPO12	P17123	173 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	RAD57	P25301	460 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	PRM5	P40476	318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	AZR1	P50080	613 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	SMA2	Q04658	369 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	SDH3	P33421	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	LTV1	P34078	463 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
DSE3	YOR264W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	RSA1	Q08932	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	ERV2	Q12284	196 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	COX3	P00420	269 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	PEX5	P35056	612 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	SWH1	P35845	1188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSE3	YOR264W	YBR139W	P38109	508 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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