RNA–Protein interactions for RNA: YOR156C

NFI1, Transcript of SUMO E3 ligase, yeast

Gene NFI1, Length 2,181 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NFI1	YOR156C	RTT107	P38850	1070 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	YAL037W	P39728	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	PEX25	Q02969	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	PIR3	Q03180	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	BUG1	Q12191	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	DPH2	P32461	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	GPI15	P53961	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	MDM31	P38880	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
NFI1	YOR156C	YDL186W	P48568	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	YNR048W	P53740	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	PMR1	P13586	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	YPS6	P40583	537 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	HMS2	P47175	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	MRP51	Q02950	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	STN1	P38960	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	MST28	P39552	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	GAT2	P40209	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	POP6	P53218	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	URH1	Q04179	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	SGT1	Q08446	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	LSB5	P25369	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	CRZ1	P53968	678 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	TIM18	Q08749	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	SKS1	Q12505	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NFI1	YOR156C	ALG1	P16661	449 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	OPI1	P21957	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	CAF40	P53829	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	NDL1	Q06568	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	REX4	Q08237	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	CHS1	P08004	1131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	MLH1	P38920	769 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	YJL213W	P40896	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	MLC1	P53141	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	RSN1	Q03516	953 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	SPO12	P17123	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	AGA1	P32323	725 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	SSN8	P47821	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	ATG34	Q12292	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	GPI16	P38875	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	YAT2	P40017	923 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	IMA2	Q08295	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	RAD57	P25301	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	FRE6	Q12473	712 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	RAD61	Q99359	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	RGT1	P32862	1170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	MIX23	P38162	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	PFF1	P38244	976 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	FAA2	P39518	744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	IDP2	P41939	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	PHB2	P50085	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	MUM3	Q08750	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	TIP41	Q12199	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	RUP1	Q12242	671 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	STP2	P38704	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	WSC2	P53832	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	SRL2	Q12020	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	CHS6	P40955	746 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	LAM5	P43560	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	PIB2	P53191	635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	MEH1	Q02205	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	BET5	Q03630	159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	PPT2	Q12036	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	YGL260W	P53056	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NFI1	YOR156C	ROG1	P53118	685 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 777 ms