RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	AIM36	Q03798	255 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MRX10	Q05648	414 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MFG1	Q07684	458 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	VTH2	P40890	1549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	TPK1	P06244	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	COS2	P0CX12	379 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	COS3	P0CX13	379 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MAS2	P11914	482 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	TOD6	P34219	525 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ERV15	P38312	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	CPR7	P47103	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SPC98	P53540	846 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
EXO1	YOR033C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
EXO1	YOR033C	TEP1	P53916	434 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HXT15	P54854	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	STP1	Q00947	519 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	AIM32	Q04689	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HDA2	Q06629	674 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	LDB18	Q07887	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YCK1	P23291	538 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	DCC1	P25559	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RAD14	P28519	371 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ATP11	P32453	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ECT1	P33412	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PEX28	P38848	579 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RBG1	P39729	369 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	KRE29	P40026	464 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YKE4	P40544	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	GAB1	P41733	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PFA3	P42836	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YAR1	P46683	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MRK1	P50873	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	COS12	P53053	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SLD5	Q03406	294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	GIS4	Q04233	774 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YOP1	Q12402	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	CAP2	P13517	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HEM15	P16622	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PHO81	P17442	1178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	UGA1	P17649	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	AGP1	P25376	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	AHC2	P25649	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
EXO1	YOR033C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SRO77	P38163	1010 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	FMO1	P38866	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MLH1	P38920	769 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YJL107C	P42947	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MRX5	P47007	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HOC1	P47124	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YGR017W	P53210	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HHO1	P53551	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	REG1	Q00816	1014 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SHR3	Q02774	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	TPP1	Q03796	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	APC4	Q04601	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MFB1	Q04922	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MDM30	Q05930	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SCP1	Q08873	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	TPK2	P06245	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	BAR1	P12630	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	CDC42	P19073	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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