RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	CCA1	P21269	546 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	VPS3	P23643	1011 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YSP3	P25036	478 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	CTR86	P25355	563 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ROT2	P38138	954 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YBL029W	P38201	376 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	APE4	P38821	490 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.49	□□□□□ -1.53	not detected
PSH1	YOL054W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	AVT6	P40074	448 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SWP82	P43554	623 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	STB2	P46679	850 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	GUF1	P46943	645 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YJL055W	P47044	245 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MPS3	P47069	682 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	UBC11	P52492	156 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	GND2	P53319	492 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RMI1	Q02685	241 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TRS31	Q03337	283 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ENT2	Q05785	613 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SGT1	Q08446	395 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	IRC13	Q08630	104 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	UAF30	Q08747	228 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	FRE5	Q08908	694 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	GPM2	Q12008	311 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TPK3	P05986	398 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	APE1	P14904	514 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YPK3	P38070	525 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MUP3	P38734	546 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YJL193W	P39542	402 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YRB2	P40517	327 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ELP2	P42935	788 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YJL163C	P46996	555 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	NAS6	P50086	228 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	STB4	P50104	949 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	CIK1	Q01649	594 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SWP1	Q02795	286 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ATG21	Q02887	496 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	NHP10	Q03435	203 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YDR131C	Q03899	556 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SWC7	Q06707	132 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RSA1	Q08932	381 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	DDC1	Q08949	612 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	NBP2	Q12163	236 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	COX5A	P00424	153 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ABF1	P14164	731 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	VPS33	P20795	691 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	CMK2	P22517	447 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ERG4	P25340	473 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YIH1	P25637	258 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	ITR2	P30606	609 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RCN1	P36054	211 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YHR218W	P38899	603 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	FAD1	P38913	306 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RBG1	P39729	369 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	FMP52	P40008	231 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	KRE29	P40026	464 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MRX6	P48564	524 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MEP3	P53390	489 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	CDC14	Q00684	551 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	STP1	Q00947	519 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	TOF2	Q02208	771 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	SPP2	Q02521	185 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	RSN1	Q03516	953 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	GAL83	Q04739	417 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	HRD3	Q05787	833 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	VID22	Q05934	901 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	YOL159C	Q08300	171 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	MED11	Q99278	115 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PSH1	YOL054W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SUC2	P00724	532 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GAL80	P04387	435 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PET122	P10355	254 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GCN3	P14741	305 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54

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