RNA–Protein interactions for RNA: YMR305C

SCW10, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW10, Length 1,170 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW10	YMR305C	GPI8	P49018	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	MRK1	P50873	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	SFB2	P53953	876 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	YHM2	Q04013	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	RAD30	Q04049	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	EMI1	Q04406	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	VPS74	Q06385	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	THI73	Q07904	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	VPS68	Q12016	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	ATG29	Q12092	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	NSI1	Q12457	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	COR1	P07256	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	PEX3	P28795	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	CDC5	P32562	705 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	ATO2	P32907	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	SPO23	P33757	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	YKR015C	P36111	568 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	GLG1	P36143	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	BET3	P36149	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	YBR285W	P38354	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	MED6	P38782	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	MTG2	P38860	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	GGC1	P38988	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	SER33	P40510	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	MPH1	P40562	993 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	PFA3	P42836	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	ELP2	P42935	788 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	BIR1	P47134	954 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	TOM22	P49334	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	SKP1	P52286	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	IGO1	P53897	168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	YNL140C	P53910	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	HXT15	P54854	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	COS7	Q07788	383 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	NSE1	Q07913	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	THP1	Q08231	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	RSA1	Q08932	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	TRM8	Q12009	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	NKP1	Q12493	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	SRN2	Q99176	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW10	YMR305C	MSB2	P32334	1306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	ATP4	P05626	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	BET2	P20133	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	MRPL6	P32904	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	SPC34	P36131	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	MCM7	P38132	845 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	COS111	P38308	924 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	SIC1	P38634	284 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	INM1	P38710	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	GOS1	P38736	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	YHR078W	P38799	552 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	ATG7	P38862	630 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	GCV1	P48015	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	RRN5	Q02983	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	MET31	Q03081	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	ARG7	Q04728	441 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	ENT2	Q05785	613 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	LOT6	Q07923	191 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	VIK1	Q12045	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	RGT2	Q12300	763 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	NTO1	Q12311	748 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW10	YMR305C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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