RNA–Protein interactions for RNA: YMR224C

MRE11, Transcript of Nuclease subunit of the MRX complex with Rad50p and Xrs2p, yeast

Gene MRE11, Length 2,079 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRE11	YMR224C	RMD5	Q12508	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	HXT2	P23585	541 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	SNC1	P31109	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	UTR4	P32626	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RGT1	P32862	1170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	MRPL37	P36532	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	APD1	P38281	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	SPG5	P42933	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	MRK1	P50873	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	DSL1	P53847	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	ERV41	Q04651	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	VAC14	Q06708	880 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	HMX1	P32339	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	ELM1	P32801	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	CTM1	P38818	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YHR122W	P38829	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	ALP1	P38971	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	GTO1	P48239	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YGL114W	P53134	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	LSB1	P53281	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	SUN4	P53616	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	MCP2	Q06567	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RNH203	Q12338	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RAD57	P25301	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	PPZ1	P26570	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	TPO5	P36029	618 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	FAU1	P40099	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YNL146W	P53906	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	URH1	Q04179	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	URC2	Q04411	772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RRG8	Q06109	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	BSP1	Q06604	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	SSK1	Q07084	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	AAD15	Q08361	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	LDB17	Q12342	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RPN13	O13563	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	UNG1	P12887	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	GID7	P25569	745 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	ATM1	P40416	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	MND1	P53102	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	SEG1	Q04279	960 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	ECM7	Q06200	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	GEP3	Q08622	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	PUS9	Q12069	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	FLO10	P36170	1169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YAL037W	P39728	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YEL020C	P39994	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YGL185C	P53100	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	VOA1	P53262	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	NUP53	Q03790	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	CSI1	Q04368	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	TPO3	Q06451	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	ARV1	Q06541	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RKM5	Q12367	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	EDE1	P34216	1381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	PET123	P17558	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	CTR86	P25355	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	NTG1	P31378	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	SPT10	P35208	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	LEU5	P38702	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	PMT5	P52867	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	GPI1	P53306	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	NUP100	Q02629	959 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	ARR1	Q06596	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	PFA4	Q12006	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	DST1	P07273	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	YCL068C	P25593	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	COT1	P32798	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	CHS7	P38843	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRE11	YMR224C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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