RNA–Protein interactions for RNA: YMR198W

CIK1, Transcript of Kinesin-associated protein, yeast

Gene CIK1, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIK1	YMR198W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
CIK1	YMR198W	PUT4	P15380	627 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YEL045C	P32616	141 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	CST26	P38226	397 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YSW1	P38280	609 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YIL089W	P40500	205 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	DOT5	P40553	215 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YGR066C	P53242	292 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ARK1	P53974	638 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	GAL7	P08431	366 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	LTV1	P34078	463 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RRT2	P38332	387 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	WSS1	P38838	269 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	AIM22	P47051	409 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RAD17	P48581	401 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	YGR111W	P53265	400 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	TMS1	Q12116	473 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RKM5	Q12367	367 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	CHS1	P08004	1131 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	MSN2	P33748	704 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	SEF1	P34228	1148 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RPC37	P36121	282 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	YBL028C	P38202	106 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	PEX18	P38855	283 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	YIL067C	P40514	678 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	CHS6	P40955	746 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	VPS74	Q06385	345 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	YEH1	Q07804	573 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RRT8	Q08219	342 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	DCI1	Q08558	271 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	ATG29	Q12092	213 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	ERV2	Q12284	196 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	DAP2	P18962	818 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	PIM1	P36775	1133 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	DUG2	P38149	878 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	MLC1	P53141	149 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	ECM18	Q04623	453 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	SOV1	Q04748	898 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	THP1	Q08231	455 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	VPS54	Q12071	889 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	CLC1	P17891	233 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	HMX1	P32339	317 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	GIM3	P53900	129 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	INP2	Q03824	705 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	PPM1	Q04081	328 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	MDM36	Q06820	579 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	YPT6	Q99260	215 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	HIP1	P06775	603 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	VPS3	P23643	1011 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	YME1	P32795	747 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	CMC1	P36064	111 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	MTC6	P38849	526 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	FAU1	P40099	211 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CIK1	YMR198W	GPI1	P53306	609 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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