RNA–Protein interactions for RNA: YMR028W

TAP42, Transcript of Essential protein involved in the TOR signaling pathway, yeast

Gene TAP42, Length 1,101 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAP42	YMR028W	MUM3	Q08750	479 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	FDH1	Q08911	376 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	YKL097C	P34245	136 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	BYE1	P36106	594 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	ARA1	P38115	344 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	RFC3	P38629	340 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	MST28	P39552	234 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	SAS2	P40963	338 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	SSN8	P47821	323 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	SNT1	P25357	1226 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	ITR1	P30605	584 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	SIN4	P32259	974 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	RIB5	P38145	238 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	BMT2	P38278	337 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	YHR054C	P38780	354 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	PRM5	P40476	318 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	LAM5	P43560	674 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	COS5	P47187	383 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	YGL138C	P53122	345 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	MDG1	P53885	366 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	HER2	Q03557	464 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	COS7	Q07788	383 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	TIM18	Q08749	192 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TAP42	YMR028W	YRF1-4	O13559	1382 aa		2.59	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	REC107	P21651	314 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SPS22	P25380	463 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	GEX1	P25596	615 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	KRE2	P27809	442 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	YME2	P32843	850 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	STB6	P36085	766 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
TAP42	YMR028W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	FRE4	P53746	719 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	MDM30	Q05930	598 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	VAM3	Q12241	283 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	HSP42	Q12329	375 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	RAD61	Q99359	647 aa		2.58	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	PRB1	P09232	635 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SLY1	P22213	666 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	RHB1	P25378	209 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	YCR051W	P25631	222 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	BEM1	P29366	551 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	HIR2	P32480	875 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SSU1	P41930	458 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	HMS2	P47175	358 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	YNR048W	P53740	393 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	HXT11	P54862	567 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SPC19	Q03954	165 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	ROY1	Q04847	553 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	ORT1	Q12375	292 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	ISN1	Q99312	450 aa		2.57	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	KKQ8	P36004	724 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	MSG5	P38590	489 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	NCA3	P46955	337 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SKO1	Q02100	647 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	KAP120	Q02932	1032 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	YMR181C	Q03231	154 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	DON1	Q05610	365 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	REX4	Q08237	289 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SGT1	Q08446	395 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	IES4	Q08561	116 aa		2.56	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	CTR86	P25355	563 aa		2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	ADK2	P26364	225 aa		2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	YBR137W	P38276	179 aa		2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	BET5	Q03630	159 aa		2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	PPM1	Q04081	328 aa		2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SOR2	Q07786	357 aa		2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	RMD5	Q12508	421 aa		2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	AFI1	Q99222	893 aa		2.55	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SCEI	P03882	235 aa		2.54	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	PDX1	P16451	410 aa		2.54	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	RPC53	P25441	422 aa		2.54	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	YDR131C	Q03899	556 aa		2.54	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TAP42	YMR028W	CCH1	P50077	2039 aa		2.53	□□□□□ -2

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