RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	NUP192	P47054	1683 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	REV1	P12689	985 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	HEM15	P16622	393 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	GYP6	P32806	458 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YIL067C	P40514	678 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	GCD10	P41814	478 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	VTC2	P43585	828 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	IRC6	P43615	237 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	PCP1	P53259	346 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	JJJ1	P53863	590 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	APC1	P53886	1748 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	PPH22	P23595	377 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	SWH1	P35845	1188 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	SMF1	P38925	575 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	IBD2	P53892	351 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	SMA2	Q04658	369 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	PBA1	Q05778	276 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	COG4	Q06096	861 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	ESA1	Q08649	445 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	CHS1	P08004	1131 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YCR041W	P37265	110 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	ESL1	P40456	1118 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	ARK1	P53974	638 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	TAP42	Q04372	366 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	GRX6	Q12438	231 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YRF1-6	P53819	1859 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	RED1	P14291	827 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	ROX1	P25042	368 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	CPR4	P25334	318 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	VHC1	P38329	1120 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	SHC1	P39000	512 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	RRT5	P43607	289 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	SSN8	P47821	323 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YIP1	P53039	248 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	MRP51	Q02950	344 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	HSP31	Q04432	237 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	VTA1	Q06263	330 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YKR070W	YKR070W	NAM9	P27929	486 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	NIP100	P33420	868 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	SDH3	P33421	198 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	HCS1	P34243	683 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	LAM5	P43560	674 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	RTN2	Q12443	393 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	RTP1	Q12751	981 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	CLB3	P24870	427 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	SPS22	P25380	463 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	RIB5	P38145	238 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	YHR131C	P38835	850 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	TRS85	P46944	698 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	NCA3	P46955	337 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	ECM27	P47144	725 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	VPS72	Q03388	795 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	YIM1	P28625	365 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	ARA1	P38115	344 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	FMS1	P50264	508 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	SHE10	P53075	577 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	BTN2	P53286	410 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	MDM1	Q01846	1127 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	YLR287C	Q05881	355 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	SIL1	Q08199	421 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	TIM18	Q08749	192 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YKR070W	YKR070W	RRD2	Q12461	358 aa		3.44	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.5 ms