RNA–Protein interactions for RNA: YKL088W

CAB3, Transcript of Subunit of PPCDC and CoA-SPC complexes involved in CoA biosynthesis, yeast

Gene CAB3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CAB3	YKL088W	TRM2	P33753	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YBR032W	P38223	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	APD1	P38281	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SDH8	P38345	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	ARG2	P40360	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YJL107C	P42947	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SNZ3	P43545	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SWP82	P43554	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SAD1	P43589	448 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	JJJ3	P47138	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SNZ2	P53824	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SKO1	Q02100	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	ECM18	Q04623	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	PRM6	Q04705	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MSC3	Q05812	728 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MDM36	Q06820	579 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	AEP3	Q12089	606 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MRP13	P12686	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MRP4	P32902	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	CSE1	P33307	960 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MIA40	P36046	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SPC97	P38863	823 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	FMO1	P38866	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	ACO2	P39533	789 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	ELP2	P42935	788 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	STB2	P46679	850 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	FMP30	Q02883	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SPC24	Q04477	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	THI7	Q05998	598 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	TAF3	Q12297	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	EMP46	Q12396	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	COX4	P04037	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MAS2	P11914	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	URA4	P20051	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SLY1	P22213	666 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	ADH7	P25377	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MEI4	P29467	408 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YBR144C	P34215	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MRPL7	P36519	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YMC2	P38087	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SWC5	P38326	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MSR1	P38714	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MLH1	P38920	769 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	CHA4	P43634	648 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	ASG7	P46993	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	EFM3	P47163	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	DIA3	P52290	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MND1	P53102	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SPC98	P53540	846 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	NPC2	Q12408	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	WHI2	P12611	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	POX1	P13711	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	KAR4	P25583	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	LHS1	P36016	881 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	SMF2	P38778	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	FAD1	P38913	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YIL054W	P40524	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	PHB1	P40961	287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	FKH2	P41813	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YFR018C	P43599	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	FHN1	P53279	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YNR014W	P53719	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	EFM6	P53970	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	CDD1	Q06549	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	YFH1	Q07540	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	COS7	Q07788	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	AIM39	Q08223	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CAB3	YKL088W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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