RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	GPI15	P53961	229 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	TAF12	Q03761	539 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	DCI1	Q08558	271 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	AEP3	Q12089	606 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	ORT1	Q12375	292 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	CHS1	P08004	1131 aa		4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	MDL1	P33310	695 aa		4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
RPC17	YJL011C	YAL037W	P39728	267 aa		4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	YGL260W	P53056	76 aa		4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	FRE4	P53746	719 aa		4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	CAF40	P53829	373 aa		4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SGT1	Q08446	395 aa		4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	PPT2	Q12036	173 aa		4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	RMD5	Q12508	421 aa		4	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	KRE9	P39005	276 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	MST28	P39552	234 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	PHB2	P50085	310 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SCS3	P53012	380 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	YNR048W	P53740	393 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	RCF1	Q03713	159 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	IMA2	Q08295	589 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	YPL199C	Q08954	240 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	PMR1	P13586	950 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	LSB5	P25369	354 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	DPH2	P32461	534 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	BLI1	P35727	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SWH1	P35845	1188 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	RXT2	P38255	430 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	TIM18	Q08749	192 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	YLL056C	Q12177	298 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SPO12	P17123	173 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	APE4	P38821	490 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	LAM5	P43560	674 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	REX4	Q08237	289 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	MUM3	Q08750	479 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPC17	YJL011C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YUR1	P26725	428 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	PUP2	P32379	260 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RGT1	P32862	1170 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YBR137W	P38276	179 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	STP2	P38704	541 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	GPI16	P38875	610 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	STN1	P38960	494 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	GAT2	P40209	560 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YPS6	P40583	537 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	CHS6	P40955	746 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	IDP2	P41939	412 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	SSN8	P47821	323 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	PEX25	Q02969	394 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RSN1	Q03516	953 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	URH1	Q04179	340 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RTT103	Q05543	409 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	SRL2	Q12020	392 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RAD61	Q99359	647 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RAD57	P25301	460 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	SWI3	P32591	825 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	MRP4	P32902	394 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	NAT2	P37293	288 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	MIX23	P38162	196 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	MDG1	P53885	366 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	BET5	Q03630	159 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	HNT3	Q08702	217 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	BUG1	Q12191	341 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	ATG34	Q12292	412 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	IBD2	P53892	351 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	PHO2	P07269	559 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	HEM15	P16622	393 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RPC17	YJL011C	SLY1	P22213	666 aa		3.93	□□□□□ -1.78

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