RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	JEN1	P36035	616 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YBR139W	P38109	508 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CST26	P38226	397 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MMS21	P38632	267 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YHR045W	P38775	560 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SPC97	P38863	823 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SEO1	P39709	593 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YER184C	P39961	794 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YEL076C	P39971	216 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	UBP7	P40453	1071 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SAD1	P43589	448 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	IRC6	P43615	237 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YJR120W	P47157	116 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	COG1	P53079	417 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YIP4	P53093	235 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MNT4	P53745	580 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YNL146W	P53906	100 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YDR476C	Q03362	224 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TRS23	Q03784	219 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	VHS1	Q03785	461 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ARG7	Q04728	441 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	FMP45	Q07651	309 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YNG1	Q08465	219 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ULA1	Q12059	462 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	REX3	Q12090	404 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SKM1	Q12469	655 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ARG3	P05150	338 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	NAM9	P27929	486 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YMC1	P32331	307 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	GSH1	P32477	678 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	NDC1	P32500	655 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PEX2	P32800	271 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YBR285W	P38354	144 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PCA1	P38360	1216 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	RIM4	P38741	713 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	APE4	P38821	490 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	FAA2	P39518	744 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YJL193W	P39542	402 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	FRT2	P39734	528 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	STL1	P39932	569 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	RMD6	P39975	231 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YAT2	P40017	923 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PHM8	P40025	321 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	DSE1	P40077	573 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YJR061W	P40355	935 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SLM1	P40485	686 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	DIE2	P50076	525 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ASE1	P50275	885 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	UBC12	P52491	188 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PIP2	P52960	996 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CUL3	P53202	744 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	HHO1	P53551	258 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YPL068C	Q02749	293 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ERO1	Q03103	563 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SCS7	Q03529	384 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TRM82	Q03774	444 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YDR131C	Q03899	556 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ARP10	Q04549	284 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SWF1	Q04629	336 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	BCH1	Q05029	724 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	VPS74	Q06385	345 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MHR1	Q06630	226 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SLD7	Q08457	257 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YOR378W	Q08902	515 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	DDC1	Q08949	612 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY3A-G	Q12173	290 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	LDB17	Q12342	491 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	HRT3	Q12347	344 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	DGK1	Q12382	290 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY3A-I	Q99219	290 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PCK1	P10963	549 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MRP7	P12687	371 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88

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