RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555263.1

ATG2B-207, Transcript of autophagy related 2B, humanhuman

TSL 2

Gene ATG2B, Length 492 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2B-207ENST00000555263 KIF5BP33176 963 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 ADAM17P78536 824 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 PTK7Q13308 1070 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 BFSP2Q13515 415 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 UBE2SQ16763 222 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 METTL7BQ6UX53 244 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SERINC5Q86VE9 423 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 TRIM50Q86XT4 487 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 C7orf31Q8N865 590 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 RETREG2Q8NC44 543 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CAGE1Q8TC20 777 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 MSRAQ9UJ68 235 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 NOD1Q9Y239 953 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 PTPRSQ13332 1948 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 TRIOO75962 3097 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 LCHNA4D1U4 455 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 H3BRB1 525 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 TREHO43280 583 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 FIBPO43427 364 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CDC45O75419 566 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 STAM2O75886 525 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CALM1P0DP23 149 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CALM2P0DP24 149 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CALM3P0DP25 149 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CDC27P30260 824 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 GNAQP50148 359 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 DEFB103AP81534 67 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 TAP1Q03518 808 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 MICU3Q86XE3 530 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 NEK1Q96PY6 1258 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 KATNAL1Q9BW62 490 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SETD4Q9NVD3 440 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 BRWD1Q9NSI6 2320 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 STXBP3O00186 592 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 TNFRSF10AO00220 468 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 LPXNO60711 386 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 BAIAP3O94812 1187 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 NEDD9Q14511 834 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 GNPTABQ3T906 1256 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 KRT40Q6A162 431 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 GPRASP2Q96D09 838 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SLC9A7Q96T83 725 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 PCYT2Q99447 389 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 CERS4Q9HA82 394 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG2B-207ENST00000555263 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 ZBTB43O43298 467 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 EDIL3O43854 480 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 ACTN1P12814 892 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 COL9A1P20849 921 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 HSPA4P34932 840 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 THPOP40225 353 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG2B-207ENST00000555263 SP4Q02446 784 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms