RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482592.5

SMYD3-211, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-211ENST00000482592 LBX2Q6XYB7 198 aa7.06□□□□□ -1.28
SMYD3-211ENST00000482592 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
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SMYD3-211ENST00000482592 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.06□□□□□ -1.28
SMYD3-211ENST00000482592 KYQ8NBH2 561 aa7.06□□□□□ -1.28
SMYD3-211ENST00000482592 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMYD3-211ENST00000482592 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMYD3-211ENST00000482592 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.06□□□□□ -1.28
SMYD3-211ENST00000482592 CDIP1Q9H305 208 aa7.06□□□□□ -1.28
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SMYD3-211ENST00000482592 GNAT1P11488 350 aa7.04□□□□□ -1.28
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SMYD3-211ENST00000482592 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
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SMYD3-211ENST00000482592 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.01□□□□□ -1.29
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SMYD3-211ENST00000482592 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.01□□□□□ -1.29
SMYD3-211ENST00000482592 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
SMYD3-211ENST00000482592 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.01□□□□□ -1.29
SMYD3-211ENST00000482592 NCANO14594 1321 aa7.01□□□□□ -1.29
SMYD3-211ENST00000482592 GRIN2BQ13224 1484 aa7□□□□□ -1.29
SMYD3-211ENST00000482592 NOBOXO60393 691 aa7□□□□□ -1.29
SMYD3-211ENST00000482592 TUSC3Q13454 348 aa7□□□□□ -1.29
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