RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-205ENST00000468371 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 GGPS1O95749 300 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 CYP21A2P08686 494 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 DNERQ8NFT8 737 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 ODR4Q5SWX8 454 aa6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 IWS1Q96ST2 819 aa6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 NFIBO00712 420 aa6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 JAG1P78504 1218 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 CNNM3Q8NE01 707 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 NEK11Q8NG66 645 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 MAP4K1Q92918 833 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 RUFY1Q96T51 708 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 HIPK3Q9H422 1215 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 MARK3P27448 753 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 FPGSQ05932 587 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.67□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 FGBP02675 491 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 36.1
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SHQ1-205ENST00000468371 LRRC41Q15345 812 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 AFG1LQ8WV93 481 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 GAS7O60861 476 aa6.67□□□□□ -1.34
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