RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438413.5

MUC1-211, Transcript of mucin 1, cell surface associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MUC1, Length 927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1-211ENST00000438413 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.14■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 HOXC8P31273 242 aa22.14■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 GNPTABQ3T906 1256 aa22.14■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.14■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.14■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 SENP2Q9HC62 589 aa22.14■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.13■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 TREHO43280 583 aa22.13■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 CYP21A2P08686 494 aa22.13■■□□□ 1.13
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MUC1-211ENST00000438413 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 FAM122AQ96E09 287 aa22.13■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.13■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.13■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 STAM2O75886 525 aa22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 CTSHP09668 335 aa22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 ICAM3P32942 547 aa22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 TROAPQ12815 778 aa22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 WTAPQ15007 396 aa22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 SEPT8Q92599 483 aa22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 USP26Q9BXU7 913 aa22.12■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 CAND2O75155 1236 aa22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 NEDD9Q14511 834 aa22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 TTC22Q5TAA0 569 aa22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 METTL7BQ6UX53 244 aa22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.11■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 FIBPO43427 364 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 GNAT1P11488 350 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 PTH1RQ03431 593 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 NCOA7Q8NI08 942 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 SAMD11Q96NU1 681 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 YME1L1Q96TA2 773 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 GPR20Q99678 358 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 SETD4Q9NVD3 440 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 COL4A6Q14031 1691 aa22.1■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 E7EWF7 191 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 UPP2O95045 317 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 KCNA5P22460 613 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 PDE4AP27815 886 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 SEMA3FQ13275 785 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 EPC2Q52LR7 807 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 TRIM50Q86XT4 487 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 TOP1MTQ969P6 601 aa22.09■■□□□ 1.13
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MUC1-211ENST00000438413 CD320Q9NPF0 282 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.09■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 PTPROQ16827 1216 aa22.08■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.08■■□□□ 1.13
MUC1-211ENST00000438413 KAT6AQ92794 2004 aa22.07■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 CHMLP26374 656 aa22.07■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.07■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 APBB2Q92870 758 aa22.07■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.07■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 ANTXR2P58335 489 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 ARHGAP4P98171 946 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 SP4Q02446 784 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 GPM6BQ13491 265 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 CUL5Q93034 780 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.06■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 H3BNC9 293 aa22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 GPR37L1O60883 481 aa22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 IL9P15248 144 aa22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 ADAM17P78536 824 aa22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 FAM26DQ5JW98 314 aa22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 TMEM192Q8IY95 271 aa22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.05■■□□□ 1.12
MUC1-211ENST00000438413 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.05■■□□□ 1.12
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