RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL9P15248 144 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 HIC1Q14526 733 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEC23AQ15436 765 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 SORBS3O60504 671 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGS20O76081 388 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 GGPS1O95749 300 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 TGFB3P10600 412 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 EPC2Q52LR7 807 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEPT8Q92599 483 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 YME1L1Q96TA2 773 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 GHRHRQ02643 423 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 WTAPQ15007 396 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 BANK1Q8NDB2 785 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEK9Q8TD19 979 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 H3BNC9 293 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 OPLAHO14841 1288 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC27A2O14975 620 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF20Q5VTR2 975 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 TOP1MTQ969P6 601 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 UIMC1Q96RL1 719 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM50BQ9Y247 325 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 H3BRB1 525 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 CAND2O75155 1236 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPM6BQ13491 265 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 PGM5Q15124 567 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLRF2D3W0D1 207 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 UPP2O95045 317 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCND2P30279 289 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 SP2Q02086 613 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 NECTIN1Q15223 517 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM192Q8IY95 271 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB5O15062 677 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 TREHO43280 583 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXC8P31273 242 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 MCM5P33992 734 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANTXR2P58335 489 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAF1Q13077 416 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 SIP14410 1827 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 DCXO43602 365 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRC1O43663 620 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNAT1P11488 350 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL31RAQ8NI17 732 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTMR8Q96EF0 704 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTA3Q9BTC8 594 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP26Q9BXU7 913 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 LGALS2P05162 132 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTSHP09668 335 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 POLR2MP0CAP2 368 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRM4Q14833 912 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 APBB2Q92870 758 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 PIEZO1Q92508 2521 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 POTEB3A0JP26 581 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 NCK2O43639 380 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL19A1Q14993 1142 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNPTABQ3T906 1256 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 POTEBQ6S5H4 581 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.133e-6■□□□□ 9.4
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