RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W GAL3P13045 520 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W SCL1P21243 252 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W VPH2P32341 215 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W SPC34P36131 295 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data8.99□□□□□ -0.97not detected
BRR1YPR057W BIO3P50277 480 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W YPL071CQ02864 156 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W SWF1Q04629 336 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W LOT6Q07923 191 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W SRO7Q12038 1033 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W YPR117WQ06116 2489 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W MSB2P32334 1306 aa8.99□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W NTG1P31378 399 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W ARA1P38115 344 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W DSF2P38213 736 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W TRM7P38238 310 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W THO1P40040 218 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W TOM22P49334 152 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W RTS3P53289 263 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W BIO5P53744 561 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W BNI4P53858 892 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W SPO19Q03029 223 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W RSA1Q08932 381 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W PFA4Q12006 378 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W GPR1Q12361 961 aa8.98□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W COR1P07256 457 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W LAT1P12695 482 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W IDH2P28241 369 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W PTP2P29461 750 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W PET309P32522 965 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W PET127P32606 800 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W RRN10P38204 145 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W MNT3P40549 630 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W MPH1P40562 993 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W SSU1P41930 458 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W PMT4P46971 762 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W YJL043WP47053 257 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W SDT1P53078 280 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W ATG17Q06410 417 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W ARR1Q06596 294 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W REH1Q06709 432 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W VIK1Q12045 647 aa8.97□□□□□ -0.97
BRR1YPR057W RHO1P06780 209 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ALG7P07286 448 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W FAR1P21268 830 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MEI5P32489 222 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W NUP2P32499 720 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W TIF3P34167 436 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YBR285WP38354 144 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W FMO1P38866 432 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W BAT1P38891 393 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MET30P39014 640 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RGA1P39083 1007 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MAD2P40958 196 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PSA1P41940 361 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ERG26P53199 349 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W IGO1P53897 168 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RTT10Q08924 1013 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W TFB4Q12004 338 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YOR114WQ12219 294 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YDL199CQ12407 687 aa8.96□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W HOM2P13663 365 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W UBC8P28263 218 aa8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W CTS1P29029 562 aa8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W CYS4P32582 507 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SPC42P36094 363 aa8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W DLD3P39976 496 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YEL020CP39994 560 aa8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W YRB2P40517 327 aa8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PRM10P42946 383 aa8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data8.95□□□□□ -0.98not detected
BRR1YPR057W EMC2P47133 292 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W FAA4P47912 694 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W GAD1Q04792 585 aa8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ROY1Q04847 553 aa8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W FAB1P34756 2278 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W TIM9O74700 87 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W GPH1P06738 902 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W CMP2P14747 604 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W CTR86P25355 563 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W ADE1P27616 306 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W RPC82P32349 654 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W SAC1P32368 623 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W TCD2P36101 447 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W STP2P38704 541 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W PFS1P38872 237 aa8.94□□□□□ -0.98
BRR1YPR057W LAS21P40367 830 aa8.94□□□□□ -0.98
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