RNA–Protein interactions for RNA: YMR198W

CIK1, Transcript of Kinesin-associated protein, yeast

Gene CIK1, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIK1	YMR198W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	DAD2	P36162	133 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PCH2	P38126	564 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YBP1	P38315	674 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SMF1	P38925	575 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	MET18	P40469	1032 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	FAR3	P46671	204 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YGR126W	P53274	230 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YLR456W	Q06199	204 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PSY3	Q12318	242 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	GPM3	Q12326	303 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SEC39	Q12745	709 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YCK1	P23291	538 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YCR007C	P25354	239 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	NTG1	P31378	399 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SUR1	P33300	382 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SRO77	P38163	1010 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YGR127W	P53275	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ARP5	P53946	755 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	NGL3	Q03210	505 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	TAP42	Q04372	366 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	RIM20	Q12033	661 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	MER1	P16523	270 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	CPR2	P23285	205 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YCR051W	P25631	222 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YBR144C	P34215	104 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	COY1	P34237	679 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	UBP11	P36026	717 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ICS2	P38284	255 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ALG8	P40351	577 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SEC9	P40357	651 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	TCB2	P48231	1178 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SHE4	P51534	789 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	RPN14	P53196	417 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	DON1	Q05610	365 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	BSC6	Q08280	497 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	HEL1	P36113	551 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	MRPL40	P36534	297 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	REG2	P38232	338 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YHR054C	P38780	354 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	CTM1	P38818	585 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YEL057C	P39983	233 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	LCL3	P53153	274 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	TOF2	Q02208	771 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YML037C	Q03703	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	IVY1	Q04934	453 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	COQ9	Q05779	260 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	MMR1	Q06324	491 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	MRP13	P12686	339 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	MRPL25	P23369	157 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	UTR4	P32626	227 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	CCT6	P39079	546 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	EPL1	P43572	832 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YRM1	Q12340	786 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	AFI1	Q99222	893 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SGS1	P35187	1447 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ELO2	P25358	347 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YIH1	P25637	258 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PHO91	P27514	894 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ERV1	P27882	189 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YUH1	P35127	236 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
CIK1	YMR198W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	VID24	P38263	362 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YDR089W	P38966	869 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	CIN4	P39110	191 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	LSB1	P53281	241 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YGR266W	P53326	701 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ROY1	Q04847	553 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	NAM9	P27929	486 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	YIM1	P28625	365 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	MRP4	P32902	394 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	SRB2	P34162	210 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	MET28	P40573	187 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	GWT1	P47026	490 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	IRC15	Q02733	499 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CIK1	YMR198W	ISN1	Q99312	450 aa		3.1	□□□□□ -1.91

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