RNA–Protein interactions for RNA: YLR345W

YLR345W, Transcript of Similar to 6-phosphofructo-2-kinase enzymes, yeast

Gene YLR345W, Length 1,530 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR345W	YLR345W	SEC66	P33754	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YUH1	P35127	236 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ECM15	P35195	104 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RRT2	P38332	387 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YGL260W	P53056	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PPM1	Q04081	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	MRE11	P32829	692 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PMT1	P33775	817 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	HCS1	P34243	683 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	HXT14	P42833	540 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YGR126W	P53274	230 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	SAM50	P53969	484 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PLP2	Q12017	286 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	TIP41	Q12199	356 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	GAL80	P04387	435 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PUT4	P15380	627 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	DAP2	P18962	818 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ATS1	P31386	333 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	AFG1	P32317	509 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	CTM1	P38818	585 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	CIN4	P39110	191 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	VPS52	P39904	641 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	EPL1	P43572	832 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PET130	P47065	347 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YGR266W	P53326	701 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	UAF30	Q08747	228 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RLM1	Q12224	676 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	GAL7	P08431	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PEP5	P12868	1029 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	SNT1	P25357	1226 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	BUD14	P27637	709 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YME2	P32843	850 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	SLM4	P38247	162 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YHR210C	P38893	341 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	AIM22	P47051	409 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	AQR1	P53943	586 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	SHR3	Q02774	210 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	FIN1	Q03898	291 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	HIP1	P06775	603 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	SEC62	P21825	274 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	SPC110	P32380	944 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	MRP4	P32902	394 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
YLR345W	YLR345W	YTA12	P40341	825 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ALG5	P40350	334 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	IKS1	P47042	667 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YJR154W	P47181	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	CRZ1	P53968	678 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	MSC3	Q05812	728 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ARV1	Q06541	321 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YEH2	Q07950	538 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	VPS54	Q12071	889 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PHO2	P07269	559 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RML2	P32611	393 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PIM1	P36775	1133 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	URB2	P47108	1174 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	LSB1	P53281	241 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	TAP42	Q04372	366 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YFH1	Q07540	174 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	MED2	Q12124	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	MER1	P16523	270 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	NDI1	P32340	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	MRPL4	P36517	319 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 107.6 ms