RNA–Protein interactions for RNA: YLR233C

EST1, Transcript of TLC1 RNA-associated factor involved in telomere length regulation, yeast

Gene EST1, Length 2,100 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST1	YLR233C	OM14	P38325	134 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YER184C	P39961	794 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	ACA1	P39970	489 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	GAT2	P40209	560 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YJL144W	P47009	104 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YIP1	P53039	248 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YGL262W	P53054	175 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YGR067C	P53243	804 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	PEX8	P53248	589 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	NRM1	P53718	249 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YNR048W	P53740	393 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	KTR6	P54070	446 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	SLG1	P54867	378 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	MCH1	Q07376	486 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	NBP2	Q12163	236 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YOL087C	Q99247	1116 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	COR1	P07256	457 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YIH1	P25637	258 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.17	□□□□□ -2.38	not detected
EST1	YLR233C	UBP11	P36026	717 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YCR041W	P37265	110 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	REG2	P38232	338 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	MUM2	P38236	366 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	WSS1	P38838	269 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	CHL4	P38907	458 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	ERP2	P39704	215 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	FRT2	P39734	528 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	OXA1	P39952	402 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YER010C	P40011	234 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	JLP2	P40206	208 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	BNS1	P50084	137 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	MTQ1	P53944	314 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YET2	Q04210	160 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	VID22	Q05934	901 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	RIF2	Q06208	395 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YPR022C	Q12139	1133 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	SPE4	Q12455	300 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	RTP1	Q12751	981 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YPR096C	O13587	100 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	ATP4	P05626	244 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	NAM2	P11325	894 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	UTR5	P32630	166 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	HEL1	P36113	551 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	MAL33	P38157	468 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	STP2	P38704	541 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	MSR1	P38714	643 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	POP1	P41812	875 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	BIR1	P47134	954 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	BLS1	Q06071	122 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	RAV1	P47104	1357 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	SGS1	P35187	1447 aa		0.17	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	TOP1	P04786	769 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	MSI1	P13712	422 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	PUT4	P15380	627 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	KAR3	P17119	729 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YPS1	P32329	569 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	GYP6	P32806	458 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	CBP4	P37267	147 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	CCT6	P39079	546 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	AFG3	P39925	761 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	SCC4	P40090	624 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YIR035C	P40579	254 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	STB1	P42845	420 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	ATG18	P43601	500 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	YFR057W	P43625	151 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	LCL3	P53153	274 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	HST4	P53688	370 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	FRE4	P53746	719 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	NUP116	Q02630	1113 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	FIN1	Q03898	291 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	RAD30	Q04049	632 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	IOC4	Q04213	475 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	VPS38	Q05919	439 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	ZRC1	P20107	442 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	PEP3	P27801	918 aa		0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
EST1	YLR233C	ATG12	P38316	186 aa		0.16	□□□□□ -2.38

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