RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	CAP2	P13517	287 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	MET8	P15807	274 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	DBF2	P22204	572 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	GRR1	P24814	1151 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	OCA4	P25366	362 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	NTG1	P31378	399 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	STE14	P32584	239 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	RPC34	P32910	317 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	CLG1	P35190	452 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	SWD1	P39706	426 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	YEL020C	P39994	560 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	ESL1	P40456	1118 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	CDC1	P40986	491 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	MRPL50	P53724	139 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	YNR063W	P53749	607 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	TAF12	Q03761	539 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	RCO1	Q04779	684 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	VTA1	Q06263	330 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	REH1	Q06709	432 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.18	□□□□□ -1.58	not detected
YKR041W	YKR041W	YDR056C	Q12025	205 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	GLE1	Q12315	538 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	JLP1	Q12358	412 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	GAL3	P13045	520 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	ENA1	P13587	1091 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	CLN1	P20437	546 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	SIR1	P21691	654 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	MEI5	P32489	222 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	YCR087C-A	P37263	153 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	EFM1	P38732	585 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	PEX28	P38848	579 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	HXT7	P39004	570 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	MTW1	P39731	289 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	SNG1	P46950	547 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	GNP1	P48813	663 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	STB4	P50104	949 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	TYW3	P53177	273 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	SNF12	P53628	566 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	MUK1	Q02866	612 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	GOT1	Q03554	138 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	YDR514C	Q04408	483 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	TRE2	Q08693	809 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	BUD7	Q08754	746 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	YOR022C	Q12204	715 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	NFI1	Q12216	726 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.17	□□□□□ -1.58	not detected
YKR041W	YKR041W	BBP1	Q12365	385 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	ICT1	Q12385	394 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	PNS1	Q12412	539 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	CCH1	P50077	2039 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	SPT3	P06844	337 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	HMG1	P12683	1054 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	NPR1	P22211	790 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	YCR099C	P25657	155 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	DSS4	P32601	143 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	GLG1	P36143	616 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	PIM1	P36775	1133 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	GPX2	P38143	162 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	LDB7	P38210	180 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	YHL026C	P38740	315 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	DUN1	P39009	513 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	BUR6	P40096	142 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	OPT1	P40897	799 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	BIT61	P47041	543 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	SPC105	P53148	917 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	DAM1	P53267	343 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	SPC98	P53540	846 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	GOR1	P53839	350 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	PEX13	P80667	386 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YKR041W	YKR041W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms