RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	THI21	Q08975	551 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YDL176W	Q12027	708 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YOR022C	Q12204	715 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PSY3	Q12318	242 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SKM1	Q12469	655 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	DFG16	Q99234	619 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	TPK3	P05986	398 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	MET17	P06106	444 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	TPK2	P06245	380 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	RAD10	P06838	210 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PUT2	P07275	575 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	CAP2	P13517	287 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ERS1	P17261	260 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SNF5	P18480	905 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SFL1	P20134	766 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	AEP2	P22136	580 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	VMA16	P23968	213 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	CTR86	P25355	563 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	GAC1	P28006	793 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	NTG1	P31378	399 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	THI4	P32318	326 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	HYM1	P32464	399 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YKL107W	P34251	309 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	CAF4	P36130	643 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	FMP23	P38231	175 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	UBS1	P38290	277 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	RRT2	P38332	387 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	POP4	P38336	279 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	LNP1	P38878	278 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	DUN1	P39009	513 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ECM10	P39987	644 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YEL025C	P39991	1188 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	DSE1	P40077	573 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	VHR1	P40522	640 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	AGP3	P43548	558 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	AIM23	P47015	356 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	IRC8	P47046	822 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	HOC1	P47124	396 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	EFM3	P47163	339 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ORC5	P50874	479 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	UBC12	P52491	188 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	IMA1	P53051	589 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	FMP48	P53233	369 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	RNH70	P53331	553 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	TEP1	P53916	434 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	TRM82	Q03774	444 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ARP10	Q04549	284 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	FAR10	Q06001	478 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SWA2	Q06677	668 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YDL121C	Q07541	149 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	THI20	Q08224	551 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	MLH3	Q12083	715 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YPR063C	Q12160	140 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	DGK1	Q12382	290 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	FOB1	O13329	566 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PET54	P10834	293 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	NFS1	P25374	497 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ATP7	P30902	174 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	FUN30	P31380	1131 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PTM1	P32857	523 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SRB2	P34162	210 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.43	□□□□□ -1.86	not detected
SOD1	YJR104C	YKL100C	P34248	587 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SDS22	P36047	338 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YBR184W	P38299	523 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YMR262W	P38430	313 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	GIC1	P38785	314 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PZF1	P39933	429 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	RMD6	P39975	231 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YMR134W	P40207	237 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	NDE1	P40215	560 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86

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