RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	FRE4	P53746	719 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CAF120	P53836	1060 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ISU1	Q03020	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RSM28	Q03430	361 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RSC3	Q06639	885 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RAD34	Q06665	692 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	APC2	Q12440	853 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	FMP16	Q12497	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PHO5	P00635	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RAD7	P06779	565 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	STE3	P06783	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DST1	P07273	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	URK1	P27515	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	UBC8	P28263	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	CDC5	P32562	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MTW1	P39731	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TOM22	P49334	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SWC4	P53201	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YNL260C	P53846	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MPS1	P54199	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DLT1	Q04216	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RAX1	Q08760	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MED2	Q12124	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TSC13	Q99190	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	STF2	P16965	84 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SDH3	P33421	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PEX28	P38848	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	HXT7	P39004	570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DUN1	P39009	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TIM17	P39515	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SWD1	P39706	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	KRE29	P40026	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YJL070C	P40361	888 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
KAR2	YJL034W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	FLC3	P53121	802 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TWF1	P53250	332 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TUB4	P53378	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SDH1	Q00711	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	VHS1	Q03785	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MFG1	Q07684	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	COS7	Q07788	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PER33	Q12144	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ATP16	Q12165	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PST1	Q12355	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ATP4	P05626	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SWI5	P08153	709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DAP2	P18962	818 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	COQ8	P27697	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GLG1	P36143	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RIB1	P38066	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	IFA38	P38286	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MTG2	P38860	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	CCT6	P39079	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YGR210C	P42942	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MDM34	P53083	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MPS2	P53159	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SPR6	Q01684	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MET31	Q03081	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GRS2	Q06817	618 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MLH3	Q12083	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MHT1	Q12525	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SRN2	Q99176	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	URA3	P03962	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PRI2	P20457	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	EPT1	P22140	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	KIN3	P22209	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SDH8	P38345	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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