RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W KEL2P50090 882 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MIG2P53035 382 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W IMA1P53051 589 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MEH1Q02205 184 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YPL071CQ02864 156 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ERO1Q03103 563 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W FMN1Q03778 218 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W TPO3Q06451 622 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W VPS54Q12071 889 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W FRE7Q12333 620 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YLR111WQ12528 110 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa3.79□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W VPS3P23643 1011 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RRT12P25381 491 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YBR139WP38109 508 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W VBA2P38358 474 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W TIF5P38431 405 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RCK2P38623 610 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data3.78□□□□□ -1.8not detected
HCA4YJL033W SPC97P38863 823 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W DIE2P50076 525 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W FYV6P53913 173 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PNG1Q02890 363 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W TDA9Q04545 1251 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W BCP1Q06338 283 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YPR202WQ08993 238 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MED4Q12343 284 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W FOB1O13329 566 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MRP13P12686 339 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W PEP5P12868 1029 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W DAP2P18962 818 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W DAL2P25335 343 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W MEI4P29467 408 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W TPS2P31688 896 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W UBP11P36026 717 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W UTP30P36144 274 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ETR1P38071 380 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W KAP104P38217 918 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W RRT2P38332 387 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W HIS2P38635 335 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W VMA7P39111 118 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SER3P40054 469 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SKP2P42843 763 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W EMC2P47133 292 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YAT1P80235 687 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W ASA1Q06822 443 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W APC5Q08683 685 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W HSP42Q12329 375 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W YLR278CQ05854 1341 aa3.78□□□□□ -1.8
HCA4YJL033W CET1O13297 549 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CBF1P17106 351 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W DBP3P20447 523 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SNT1P25357 1226 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RRN3P36070 627 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W STP2P38704 541 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YHI9P38765 294 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W FSH1P38777 243 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ACA1P39970 489 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W DDI1P40087 428 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YER186CP40101 306 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W LCB2P40970 561 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YJL107CP42947 387 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W NET1P47035 1189 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ERG13P54839 491 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SLT2Q00772 484 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RRN11Q04712 507 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SKG3Q06315 1026 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RCN2Q12044 265 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CBP1P07252 654 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W DSF1P0CX08 502 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YNR073CP0CX09 502 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W STF2P16965 84 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W SPO16P17122 198 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W MAK32P23060 363 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RAD14P28519 371 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ZIP1P31111 875 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W ARP2P32381 391 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W MRPL17P36528 281 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W CST26P38226 397 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W FTH1P38310 465 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W TSC10P38342 320 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W RPT2P40327 437 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W PFK26P40433 827 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W PSA1P41940 361 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W YGR021WP53212 290 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W LSB1P53281 241 aa3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HCA4YJL033W HER2Q03557 464 aa3.77□□□□□ -1.81
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