RNA–Protein interactions for RNA: YHR187W

IKI1, Transcript of Subunit of hexameric RecA-like ATPase Elp456 Elongator subcomplex, yeast

Gene IKI1, Length 930 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKI1	YHR187W	SHE10	P53075	577 aa		3.23	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	RTN2	Q12443	393 aa		3.23	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	RIP1	P08067	215 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	RED1	P14291	827 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	ECM25	P32525	599 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	YCR041W	P37265	110 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	VHC1	P38329	1120 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	MST28	P39552	234 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	YIL067C	P40514	678 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	YGR210C	P42942	411 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	PCP1	P53259	346 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	YLR287C	Q05881	355 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	HSP42	Q12329	375 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	RAD61	Q99359	647 aa		3.22	□□□□□ -1.89
IKI1	YHR187W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	PPH22	P23595	377 aa		3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	CLB3	P24870	427 aa		3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	CPR4	P25334	318 aa		3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	NAM9	P27929	486 aa		3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	ERG3	P32353	365 aa		3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	STB6	P36085	766 aa		3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	GOR1	P53839	350 aa		3.21	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	LDB16	P25587	256 aa		3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YIM1	P28625	365 aa		3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RIB5	P38145	238 aa		3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	REE1	P40893	198 aa		3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	LAM5	P43560	674 aa		3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	MDM1	Q01846	1127 aa		3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	TIM18	Q08749	192 aa		3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SCM3	Q12334	223 aa		3.2	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	JNM1	P36224	373 aa		3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YHR054C	P38780	354 aa		3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SAS2	P40963	338 aa		3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YNR048W	P53740	393 aa		3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SGT1	Q08446	395 aa		3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.19	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SEC63	P14906	663 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SIN4	P32259	974 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RML2	P32611	393 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YEL045C	P32616	141 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	NFU1	P32860	256 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	ARA1	P38115	344 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
IKI1	YHR187W	FAA2	P39518	744 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	COS5	P47187	383 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	TOF1	P53840	1238 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	HER2	Q03557	464 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	COS7	Q07788	383 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	REX4	Q08237	289 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.18	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	REC107	P21651	314 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	KRE2	P27809	442 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SAS3	P34218	831 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	MRPL4	P36517	319 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RFC3	P38629	340 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	PRM5	P40476	318 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SDT1	P53078	280 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	FRE4	P53746	719 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SIL1	Q08199	421 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	TMS1	Q12116	473 aa		3.17	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	PIM1	P36775	1133 aa		3.16	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	MTC6	P38849	526 aa		3.16	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	YGL138C	P53122	345 aa		3.16	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	HXT11	P54862	567 aa		3.16	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
IKI1	YHR187W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91

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