RNA–Protein interactions for RNA: YHR104W

GRE3, Transcript of Aldose reductase, yeast

Gene GRE3, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRE3	YHR104W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	EDE1	P34216	1381 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	COX3	P00420	269 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	STE3	P06783	470 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	BAR1	P12630	587 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	OM45	P16547	393 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	UTR4	P32626	227 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	RAD24	P32641	659 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	MNL1	P38888	796 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	GAT2	P40209	560 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	TAX4	P47030	604 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	VPS25	P47142	202 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ROG1	P53118	685 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PKP2	P53170	491 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	GLO2	Q05584	274 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ADY2	P25613	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	FLO10	P36170	1169 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	MSG5	P38590	489 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PAC11	P40960	533 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PHO86	P46956	311 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	TAF12	Q03761	539 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	IVY1	Q04934	453 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ARP6	Q12509	438 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	CDC21	P06785	304 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	YCR007C	P25354	239 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
GRE3	YHR104W	PPQ1	P32945	549 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	YHR218W	P38899	603 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	FAU1	P40099	211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	MPS2	P53159	387 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	YNL234W	P53857	426 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	EKI1	Q03764	534 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	VPS20	Q04272	221 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PHO92	Q06390	306 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PNS1	Q12412	539 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SFG1	Q12507	346 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PUT4	P15380	627 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	EXO70	P19658	623 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	GID7	P25569	745 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YHR131C	P38835	850 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	GPI16	P38875	610 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SSO2	P39926	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YPS6	P40583	537 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SNO3	P43544	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	TRS85	P46944	698 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SLI1	P53304	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	NUP100	Q02629	959 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SMA2	Q04658	369 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	GSH2	Q08220	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	REX4	Q08237	289 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RAD61	Q99359	647 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RAD57	P25301	460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	PET18	P25362	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	PHD1	P36093	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	QDR3	P38227	689 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	INM1	P38710	295 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	IAH1	P41734	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YGL082W	P53155	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	MSC3	Q05812	728 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	ECI1	Q05871	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	DIC1	Q06143	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	AAD15	Q08361	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	GAL7	P08431	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	HNM1	P19807	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SAG1	P20840	650 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	YSC83	P32792	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	VPS17	P32913	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRE3	YHR104W	SPT10	P35208	640 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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