RNA–Protein interactions for RNA: YFL033C

RIM15, Transcript of Protein kinase involved in cell proliferation in response to nutrients, yeast

Gene RIM15, Length 5,313 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM15	YFL033C	IPK1	Q06667	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	AFG1	P32317	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	RIB5	P38145	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YBR053C	P38235	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SIC1	P38634	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	UBA4	P38820	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SEO1	P39709	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YSA1	Q01976	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	AIM36	Q03798	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	MRX4	Q12467	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	HSF1	P10961	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	TOD6	P34219	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SET3	P36124	751 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	CAF4	P36130	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	NDE1	P40215	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	VOA1	P53262	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	VAC7	P53950	1165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	FLC1	Q08967	793 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	BBP1	Q12365	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	STB3	Q12427	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SPE1	P08432	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	HEM15	P16622	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	PRI2	P20457	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	KRE6	P32486	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ARP1	P38696	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YHR122W	P38829	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	MBP1	P39678	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	COG7	P53195	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SEG1	Q04279	960 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SKS1	Q12505	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	TPK3	P05986	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	POL4	P25615	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	TIP20	P33891	701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YBR242W	P38331	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	INM1	P38710	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	PHM8	P40025	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SFH5	P47008	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	MTC3	P53077	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	MTM1	P53320	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ZRG17	P53735	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	FMP30	Q02883	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	AI3	P03877	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	EPT1	P22140	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ADK2	P26364	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	MRPL3	P36516	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ROT2	P38138	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	MED6	P38782	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	VMA7	P39111	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	RIF2	Q06208	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	GAL4	P04386	881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	HOM3	P10869	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	UGA1	P17649	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	VPS29	P38759	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	NVJ1	P38881	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	DSE1	P40077	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	BNA6	P43619	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
RIM15	YFL033C	MLH3	Q12083	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	COX4	P04037	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	PEX34	P25584	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	BEM3	P32873	1128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SLC1	P33333	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SDH3	P33421	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SPT10	P35208	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	PET130	P47065	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	CDD1	Q06549	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	DIT1	P21623	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM15	YFL033C	SSO2	P39926	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.8 ms