RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W IMA4P0CW41 589 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W ATR1P13090 542 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W RED1P14291 827 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W CKA1P15790 372 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W CNA1P23287 553 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YSP3P25036 478 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W OCA4P25366 362 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W TFC1P32367 649 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SPR1P32603 445 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W COT1P32798 439 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SRL3P36167 246 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W RIM2P38127 377 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W TPA1P40032 644 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W LAM5P43560 674 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SAD1P43589 448 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W NUP84P52891 726 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YGL108CP53139 140 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YKR005CQ02203 525 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W TVP15Q03860 143 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W KRE28Q04431 385 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W NDL1Q06568 189 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W PSR1Q07800 427 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W IMA2Q08295 589 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W AVL9Q12500 764 aa5.39□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W PMA2P19657 947 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W MEI4P29467 408 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W ATO2P32907 282 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W OAR1P35731 278 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W NPT1P39683 429 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W PHM8P40025 321 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W STB1P42845 420 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SNZ3P43545 298 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SWP82P43554 623 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W FMP32P43557 207 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W BNA3P47039 444 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W GLO1P50107 326 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W ORC5P50874 479 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W GND2P53319 492 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W RTT102P53330 157 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YTP1P53584 459 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SNZ2P53824 298 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YPL071CQ02864 156 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W INA17Q02888 182 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W HRD3Q05787 833 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W ATG26Q06321 1198 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W ASA1Q06822 443 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W GIS3Q12418 502 aa5.38□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YMR084WA2P2R3 262 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SAM1P10659 382 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W GPA2P10823 449 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W CBS1P14066 229 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W POL4P25615 582 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W CYM1P32898 989 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W TIF3P34167 436 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W AGP2P38090 596 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W MOH1P38191 138 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W FES1P38260 290 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SWC5P38326 303 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W PHO89P38361 574 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W DSE1P40077 573 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SHE4P51534 789 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W RCF2P53721 224 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W PRO2P54885 456 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YMR209CQ03648 457 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SPC2Q04969 178 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W AAD15Q08361 143 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W IES4Q08561 116 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W HRT3Q12347 344 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W MOT1P32333 1867 aa5.37□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W MET17P06106 444 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W VMA2P16140 517 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W CLB2P24869 491 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SAT4P25333 603 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SEC1P30619 724 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SOF1P33750 489 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W STV1P37296 890 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W REG2P38232 338 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W RGI2P40188 164 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SNL1P40548 159 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YML037CQ03703 340 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W ARG7Q04728 441 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SPH1Q06160 661 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W SMC5Q08204 1093 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W APC9Q12107 265 aa5.36□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data5.35□□□□□ -1.55not detected
VHS1YDR247W URE2P23202 354 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W URA10P30402 227 aa5.35□□□□□ -1.55
VHS1YDR247W ZIP1P31111 875 aa5.35□□□□□ -1.55
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