RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	SIL1	Q08199	421 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	HER1	Q12276	1246 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	MTR10	Q99189	972 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SNF3	P10870	884 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PEP5	P12868	1029 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	KRE2	P27809	442 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SNC1	P31109	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YEL043W	P32618	956 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ROT2	P38138	954 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	THI2	P38141	450 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	BNA4	P38169	460 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	OPY1	P38271	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YER130C	P39959	443 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ATF1	P40353	525 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YNL050C	P53952	270 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SMA1	Q02651	245 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ORM2	Q06144	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	MCP2	Q06567	569 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RIP1	P08067	215 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
NUS1	YDL193W	HIR2	P32480	875 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RRF1	P38771	230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PEX18	P38855	283 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PHO90	P39535	881 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	LAM5	P43560	674 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YJR154W	P47181	346 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ALT2	P52892	507 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
NUS1	YDL193W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ADA2	Q02336	434 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
NUS1	YDL193W	RUP1	Q12242	671 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	DAL80	P26343	269 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PSO2	P30620	661 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ACP1	P32463	125 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	HOT13	P36078	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	DUG2	P38149	878 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SIF2	P38262	535 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ARP1	P38696	384 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YTA12	P40341	825 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	VHS2	P40463	436 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	GCD10	P41814	478 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	EPL1	P43572	832 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YFH1	Q07540	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	BUG1	Q12191	341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	PDE2	P06776	526 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TYR1	P20049	452 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	CNA1	P23287	553 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ADY2	P25613	283 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	COQ3	P27680	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	MRPL4	P36517	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	YBL028C	P38202	106 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SER3	P40054	469 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	CHS6	P40955	746 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ECM27	P47144	725 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SOL4	P53315	255 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	ATP23	P53722	227 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	CAC2	Q04199	468 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	SSK1	Q07084	712 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	RDR1	Q08904	546 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	REX3	Q12090	404 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUS1	YDL193W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ATP10	P18496	279 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	FAR1	P21268	830 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	SIN4	P32259	974 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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