RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559365.5

PSMA4-212, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-212ENST00000559365 F2P00734 622 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 CALM1P0DP23 149 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 CALM2P0DP24 149 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 CALM3P0DP25 149 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 TGFB3P10600 412 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 BFSP2Q13515 415 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 SPATA33Q96N06 139 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 ALG1Q9BT22 464 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 HDAC6Q9UBN7 1215 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 SLC12A7Q9Y666 1083 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 CHD9Q3L8U1 2897 aa31.17■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 RFC2P35250 354 aa31.16■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 MFSD10Q14728 455 aa31.16■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 RAB30Q15771 203 aa31.16■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 RNF20Q5VTR2 975 aa31.16■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 USP17L6PQ6QN14 398 aa31.16■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 KATNAL1Q9BW62 490 aa31.16■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 MSRAQ9UJ68 235 aa31.16■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa31.16■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 ZBBXA8MT70 800 aa31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 MEIS2O14770 477 aa31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 KIAA0753Q2KHM9 967 aa31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 SGMS1Q86VZ5 419 aa31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 BCAS3Q9H6U6 928 aa31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa31.15■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 PTPRSQ13332 1948 aa31.14■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 PIK3CDO00329 1044 aa31.14■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 PPFIA4O75335 1185 aa31.14■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 CDC45O75419 566 aa31.14■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 C7orf31Q8N865 590 aa31.14■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 CAGE1Q8TC20 777 aa31.14■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 CUL5Q93034 780 aa31.14■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa31.14■■■□□ 2.58
PSMA4-212ENST00000559365 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 DLL1O00548 723 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 STAM2O75886 525 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 ICAM3P32942 547 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 SEMA3FQ13275 785 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 TMTC3Q6ZXV5 915 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 MICU3Q86XE3 530 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 CCDC155Q8N6L0 562 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 FANCBQ8NB91 859 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 NEK1Q96PY6 1258 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 MLXIPQ9HAP2 919 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 RTEL1Q9NZ71 1219 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 RABGGTBP53611 331 aa31.12■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 GNPTABQ3T906 1256 aa31.12■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 RASEFQ8IZ41 740 aa31.12■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 CCDC82Q8N4S0 544 aa31.12■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 AFAP1L1Q8TED9 768 aa31.12■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa31.11■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 TCEANC2Q96MN5 208 aa31.11■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 C16orf70Q9BSU1 422 aa31.11■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 ACTN1P12814 892 aa31.1■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 RBL2Q08999 1139 aa31.1■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 HIC1Q14526 733 aa31.1■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 ADCK5Q3MIX3 580 aa31.1■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 TSGA10IPQ3SY00 556 aa31.1■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 PCNX4Q63HM2 1172 aa31.1■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP31.1■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 CUL9Q8IWT3 2517 aa31.09■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 KAT6AQ92794 2004 aa31.09■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 FIBPO43427 364 aa31.09■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 GPNMBQ14956 572 aa31.09■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 APOA5Q6Q788 366 aa31.09■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 PRDM12Q9H4Q4 367 aa31.09■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 PSTPIP2Q9H939 334 aa31.09■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 CHD7Q9P2D1 2997 aa31.08■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 MYOGP15173 224 aa31.08■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 SELPP16109 830 aa31.08■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 LRRC8DQ7L1W4 858 aa31.08■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 SLC28A3Q9HAS3 691 aa31.08■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 BRPF3Q9ULD4 1205 aa31.08■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa31.08■■■□□ 2.57
PSMA4-212ENST00000559365 CKBP12277 381 aa31.07■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 PTK7Q13308 1070 aa31.07■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 NEDD9Q14511 834 aa31.07■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 XRRA1Q6P2D8 792 aa31.07■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 METTL7BQ6UX53 244 aa31.07■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa31.07■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 CYFIP1Q7L576 1253 aa31.07■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 WNT8BQ93098 351 aa31.07■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa31.06■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 LGALS2P05162 132 aa31.06■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 UBE2SQ16763 222 aa31.06■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 TELO2Q9Y4R8 837 aa31.06■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 NOP56O00567 594 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa31.05■■■□□ 2.56
PSMA4-212ENST00000559365 CCDC136Q96JN2 1154 aa31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms