RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 NBNO60934 754 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 DEFB103AP81534 67 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 IL27Q8NEV9 243 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 TLL1O43897 1013 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 CXCL10P02778 98 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 PGM5Q15124 567 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 TTC22Q5TAA0 569 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 SENP2Q9HC62 589 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 KIF28PB7ZC32 967 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 HIC1Q14526 733 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 GRM4Q14833 912 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 PIGSQ96S52 555 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-207ENST00000530513 GGPS1O95749 300 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 CYP21A2P08686 494 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 KCNQ1P51787 676 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 PTK7Q13308 1070 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 CYTH3O43739 400 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 SP2Q02086 613 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 PTH1RQ03431 593 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 TRDNQ13061 729 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 GRB10Q13322 594 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 MBTPS1Q14703 1052 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 SPATA33Q96N06 139 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 LPXNO60711 386 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 PARNO95453 639 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 BMP1P13497 986 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 CCND2P30279 289 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 GDPD5Q8WTR4 605 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 PPFIA4O75335 1185 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 POLR2MP0CAP2 368 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 TROAPQ12815 778 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 ZBED2Q9BTP6 218 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa25.9■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 GJB5O95377 273 aa25.9■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 CHMLP26374 656 aa25.9■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.9■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 ERICH2A1L162 156 aa25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 E7EWF7 191 aa25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 WTAPQ15007 396 aa25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 AAK1Q2M2I8 961 aa25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 SERINC5Q86VE9 423 aa25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 BRWD1Q9NSI6 2320 aa25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-207ENST00000530513 NLRC5Q86WI3 1866 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 TGFB3P10600 412 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 COL9A1P20849 921 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 ANTXR2P58335 489 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 TRAF1Q13077 416 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 LGR5O75473 907 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 LGALS2P05162 132 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 IKBKEQ14164 716 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 NCOA7Q8NI08 942 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 RAD9AQ99638 391 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 LINC01553A4QN01 128 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 EFCAB14O75071 495 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 HOXC8P31273 242 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 THPOP40225 353 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 SEMA3FQ13275 785 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-207ENST00000530513 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
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