RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 GGPS1O95749 300 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 PFKMP08237 780 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 PSEN2P49810 448 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 CHMP4BP1P59074 171 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 GPNMBQ14956 572 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 USP17L6PQ6QN14 398 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 NFXL1Q6ZNB6 911 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 RASEFQ8IZ41 740 aa32.12■■■□□ 2.73
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HOXB3-211ENST00000490677 DEFB128Q7Z7B8 93 aa32.11■■■□□ 2.73
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HOXB3-211ENST00000490677 REV3LO60673 3130 aa32.11■■■□□ 2.73
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HOXB3-211ENST00000490677 CALM3P0DP25 149 aa32.1■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 RFC2P35250 354 aa32.1■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 RBL2Q08999 1139 aa32.1■■■□□ 2.73
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HOXB3-211ENST00000490677 C16orf70Q9BSU1 422 aa32.09■■■□□ 2.73
HOXB3-211ENST00000490677 SLC12A7Q9Y666 1083 aa32.09■■■□□ 2.73
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HOXB3-211ENST00000490677 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa32.07■■■□□ 2.72
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HOXB3-211ENST00000490677 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa32.06■■■□□ 2.72
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HOXB3-211ENST00000490677 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa32.05■■■□□ 2.72
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HOXB3-211ENST00000490677 C7orf31Q8N865 590 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXB3-211ENST00000490677 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXB3-211ENST00000490677 RTEL1Q9NZ71 1219 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXB3-211ENST00000490677 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXB3-211ENST00000490677 HOXC8P31273 242 aa32.04■■■□□ 2.72
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HOXB3-211ENST00000490677 MICAL3Q7RTP6 2002 aa32.04■■■□□ 2.72
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HOXB3-211ENST00000490677 METTL7BQ6UX53 244 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC155Q8N6L0 562 aa32.02■■■□□ 2.72
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HOXB3-211ENST00000490677 PRDM12Q9H4Q4 367 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXB3-211ENST00000490677 PSTPIP2Q9H939 334 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXB3-211ENST00000490677 LGALS2P05162 132 aa32.01■■■□□ 2.71
HOXB3-211ENST00000490677 PTK7Q13308 1070 aa32.01■■■□□ 2.71
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC8DQ7L1W4 858 aa32.01■■■□□ 2.71
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