RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 RBL2Q08999 1139 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 MFSD10Q14728 455 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 GPNMBQ14956 572 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 RETREG2Q8NC44 543 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 CAGE1Q8TC20 777 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 TGFB3P10600 412 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 MYOGP15173 224 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 RXRAP19793 462 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 KIF5BP33176 963 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 LIFRP42702 1097 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 ALG1Q9BT22 464 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.24■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 MEIS2O14770 477 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 PPFIA4O75335 1185 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 SEMA3FQ13275 785 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 ADGRE1Q14246 886 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 HIC1Q14526 733 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 TMTC2Q8N394 836 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 SPATA33Q96N06 139 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.23■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC69A6NI79 296 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 ICAM3P32942 547 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 C7orf31Q8N865 590 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 WNT8BQ93098 351 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.22■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 PTPRSQ13332 1948 aa23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 MYO9BQ13459 2157 aa23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 PIK3CDO00329 1044 aa23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 ACTN1P12814 892 aa23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 GNAQP50148 359 aa23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.21■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.2■■□□□ 1.3
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HLA-B-250ENST00000434333 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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HLA-B-250ENST00000434333 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.2■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.2■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 SLC9A7Q96T83 725 aa23.2■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.2■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.19■■□□□ 1.3
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HLA-B-250ENST00000434333 CALM2P0DP24 149 aa23.19■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 CALM3P0DP25 149 aa23.19■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 PTK7Q13308 1070 aa23.19■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.19■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.19■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.19■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 FIBPO43427 364 aa23.18■■□□□ 1.3
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HLA-B-250ENST00000434333 CXCL10P02778 98 aa23.18■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 TCTN1Q2MV58 587 aa23.18■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.18■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.18■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.18■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.18■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.18■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.17■■□□□ 1.3
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HLA-B-250ENST00000434333 HOXC8P31273 242 aa23.17■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 METTL7BQ6UX53 244 aa23.17■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 FANCBQ8NB91 859 aa23.17■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 CUL5Q93034 780 aa23.17■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 H3BRB1 525 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGEF15O94989 841 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 CA3P07451 260 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 NEDD9Q14511 834 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 MBTPS1Q14703 1052 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.16■■□□□ 1.3
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