RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 F2P00734 622 aa25.98■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 RABGGTBP53611 331 aa25.98■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.98■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.98■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.98■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 ZBBXA8MT70 800 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 MEIS2O14770 477 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 MFSD10Q14728 455 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 RASEFQ8IZ41 740 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 RETREG2Q8NC44 543 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 SPATA33Q96N06 139 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa25.97■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 PFKMP08237 780 aa25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 TGFB3P10600 412 aa25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 MYOGP15173 224 aa25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 GNAQP50148 359 aa25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 SEMA3FQ13275 785 aa25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 BFSP2Q13515 415 aa25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 HIC1Q14526 733 aa25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 GPNMBQ14956 572 aa25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
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KDELR3-202ENST00000409006 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.96■■□□□ 1.75
KDELR3-202ENST00000409006 PPFIA4O75335 1185 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 RFC2P35250 354 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 RAB30Q15771 203 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 C7orf31Q8N865 590 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 FANCBQ8NB91 859 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 MSRAQ9UJ68 235 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.95■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 PIK3CDO00329 1044 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 CALM1P0DP23 149 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 CALM2P0DP24 149 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 CALM3P0DP25 149 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 MICU3Q86XE3 530 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 WNT8BQ93098 351 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 NEK1Q96PY6 1258 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.94■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 CHD9Q3L8U1 2897 aa25.93■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.93■■□□□ 1.74
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KDELR3-202ENST00000409006 ICAM3P32942 547 aa25.93■■□□□ 1.74
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KDELR3-202ENST00000409006 RNF20Q5VTR2 975 aa25.93■■□□□ 1.74
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KDELR3-202ENST00000409006 CAGE1Q8TC20 777 aa25.93■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 A0A0C4DFX4 3053 aa25.93■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.93■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.92■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 CUL5Q93034 780 aa25.92■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.92■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 STAM2O75886 525 aa25.91■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.91■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 GNPTABQ3T906 1256 aa25.91■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.91■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.91■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 USP38Q8NB14 1042 aa25.91■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 KAT6AQ92794 2004 aa25.9■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 CKBP12277 381 aa25.9■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 ACTN1P12814 892 aa25.9■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 SELPP16109 830 aa25.9■■□□□ 1.74
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KDELR3-202ENST00000409006 APOA5Q6Q788 366 aa25.9■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.9■■□□□ 1.74
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KDELR3-202ENST00000409006 SLC28A3Q9HAS3 691 aa25.9■■□□□ 1.74
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KDELR3-202ENST00000409006 LGALS2P05162 132 aa25.89■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 TCTN1Q2MV58 587 aa25.89■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.89■■□□□ 1.74
KDELR3-202ENST00000409006 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.88■■□□□ 1.73
KDELR3-202ENST00000409006 H3BRB1 525 aa25.88■■□□□ 1.73
KDELR3-202ENST00000409006 PTK7Q13308 1070 aa25.88■■□□□ 1.73
KDELR3-202ENST00000409006 NEDD9Q14511 834 aa25.88■■□□□ 1.73
KDELR3-202ENST00000409006 METTL7BQ6UX53 244 aa25.88■■□□□ 1.73
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