RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	PPT2	Q12036	173 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	AYT1	Q12226	474 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	REC107	P21651	314 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	YIM1	P28625	365 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	GYP6	P32806	458 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	FRE2	P36033	711 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	ALG8	P40351	577 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	YJL213W	P40896	331 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	SSU1	P41930	458 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	PMU1	P36069	295 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	HAT2	P39984	401 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	SIL1	Q08199	421 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	ATR1	P13090	542 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	NIP100	P33420	868 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	VHC1	P38329	1120 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	FMS1	P50264	508 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	DSL1	P53847	754 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YNL171C	YNL171C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YCR051W	P25631	222 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	RML2	P32611	393 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ARA1	P38115	344 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YDL186W	P48568	277 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	COS10	P52924	374 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	RRD2	Q12461	358 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	HEM2	P05373	342 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	AGA1	P32323	725 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	NDI1	P32340	513 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	PNG1	Q02890	363 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	HSP31	Q04432	237 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	RTT103	Q05543	409 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	CTF3	Q12748	733 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	PDX1	P16451	410 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	RPC53	P25441	422 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YCR100C	P25606	316 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YME2	P32843	850 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YGL138C	P53122	345 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	KAP120	Q02932	1032 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	PIR3	Q03180	325 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YDR387C	Q04162	555 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	RIP1	P08067	215 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ADK2	P26364	225 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	DBF4	P32325	704 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	STB6	P36085	766 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YBP1	P38315	674 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	KRE9	P39005	276 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	COS5	P47187	383 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	AVT4	P50944	713 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	PCP1	P53259	346 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ROY1	Q04847	553 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	COS7	Q07788	383 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	HSP42	Q12329	375 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	AFI1	Q99222	893 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YOX1	P34161	385 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YCR041W	P37265	110 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	GCD10	P41814	478 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	IDP2	P41939	412 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	POP6	P53218	158 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	CAF40	P53829	373 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	WSC2	P53832	503 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ARK1	P53974	638 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ODC1	Q03028	310 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	DON1	Q05610	365 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	VAM3	Q12241	283 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	TFB1	P32776	642 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YHR054C	P38780	354 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.1 ms