RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR196W	YMR196W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	ARP4	P80428	489 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	AEP3	Q12089	606 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	PER33	Q12144	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	SIR3	P06701	978 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	ARG80	P07249	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	SIR1	P21691	654 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	CAF4	P36130	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	TRM5	P38793	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	MOB1	P40484	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	YJR154W	P47181	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	PRM1	P53835	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	YNL143C	P53908	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	RCO1	Q04779	684 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	BSC2	Q05611	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	SGO1	Q08490	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	DIN7	Q12086	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	CCH1	P50077	2039 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR196W	YMR196W	CLN2	P20438	545 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ZIP1	P31111	875 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	MAC1	P35192	417 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	THI80	P35202	319 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ARP1	P38696	384 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ARN1	P38731	627 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	TIM17	P39515	158 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	OSW5	P40219	148 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ILM1	P47155	203 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	VAC7	P53950	1165 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	IRC10	Q08118	586 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ESA1	Q08649	445 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	SEC63	P14906	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	KIN3	P22209	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	MNE1	P24720	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	PTP1	P25044	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	SED4	P25365	1065 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	SKT5	P34226	696 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	PTC1	P35182	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	MTG2	P38860	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	STB1	P42845	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	TIS11	P47977	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	FRE4	P53746	719 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	IBD2	P53892	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ACL4	Q03771	387 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	TRM12	Q04235	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	NDE2	Q07500	545 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	GPR1	Q12361	961 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	NAM9	P27929	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	LIP5	P32875	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	EFM1	P38732	585 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	PEX13	P80667	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	RIF2	Q06208	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ARO10	Q06408	635 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	SET6	Q12529	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	HEM2	P05373	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	SAN1	P22470	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	COQ8	P27697	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	MDL1	P33310	695 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	YHR045W	P38775	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	IME4	P41833	600 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	GAT1	P43574	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	RMR1	P53060	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	EMC4	P53073	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	CLD1	P53264	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	YNR061C	P53747	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	MRPL19	P53875	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	NHP10	Q03435	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	MCM21	Q06675	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	CDA1	Q06702	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	RSB1	Q08417	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	MCH5	Q08777	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	GPB1	Q08886	897 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	RBD2	Q12270	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	FCY21	P40039	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	RTS2	P40962	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	GLG2	P47011	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	YJR124C	P47159	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR196W	YMR196W	DAN4	P47179	1161 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms