RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	RAV1	P47104	1357 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	COR1	P07256	457 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	ERV1	P27882	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YPI1	P43587	155 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YJL055W	P47044	245 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SIL1	Q08199	421 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	THP1	Q08231	455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	DNA2	P38859	1522 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YME2	P32843	850 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	PCA1	P38360	1216 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SPG5	P42933	373 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	TCB2	P48231	1178 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	VPS9	P54787	451 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SPT7	P35177	1332 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	REV1	P12689	985 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	AFG1	P32317	509 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RML2	P32611	393 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	MDL1	P33310	695 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	MBB1	P39534	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	HEM2	P05373	342 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	PEP5	P12868	1029 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	CPR2	P23285	205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RAD14	P28519	371 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YIM1	P28625	365 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SHP1	P34223	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RXT2	P38255	430 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YGR149W	P48236	432 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YGL108C	P53139	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	BUD32	P53323	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SHR3	Q02774	210 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	TAP42	Q04372	366 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SOV1	Q04748	898 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	DON1	Q05610	365 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
MGR3	YMR115W	GPM3	Q12326	303 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	CTF3	Q12748	733 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SPS4	P09937	338 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	DPH2	P32461	534 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	THI2	P38141	450 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	BNA4	P38169	460 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YBP1	P38315	674 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RRT2	P38332	387 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YHR210C	P38893	341 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	ALT2	P52892	507 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YGL138C	P53122	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SYO1	Q07395	620 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	VPS54	Q12071	889 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YCR022C	P25620	114 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	ARA1	P38115	344 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	IDP2	P41939	412 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
MGR3	YMR115W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SWH1	P35845	1188 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	PMU1	P36069	295 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	URB2	P47108	1174 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	FMS1	P50264	508 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	BNA5	Q05979	453 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	URA4	P20051	364 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SLM4	P38247	162 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
MGR3	YMR115W	YGR111W	P53265	400 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SLG1	P54867	378 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	PEX25	Q02969	394 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
MGR3	YMR115W	RHO2	P06781	192 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MGR3	YMR115W	SNT1	P25357	1226 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MGR3	YMR115W	NIP100	P33420	868 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MGR3	YMR115W	MSN2	P33748	704 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MGR3	YMR115W	YHR054C	P38780	354 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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