RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W MTC4P38335 694 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W RCY1P39531 840 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W AIF1P52923 378 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W ROM1P53046 1155 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W MTC3P53077 123 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W LSG1P53145 640 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W YGR021WP53212 290 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W RSM23Q01163 450 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W MEH1Q02205 184 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W MDM30Q05930 598 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W YLR036CQ07986 203 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W ZEO1Q08245 113 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W IES4Q08561 116 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W PIN2Q12057 282 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W SAS5Q99314 248 aa2.57□□□□□ -2
YML039WYML039W RAS2P01120 322 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W ADE4P04046 510 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W DED1P06634 604 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W SSA3P09435 649 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W DAP2P18962 818 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W MKK1P32490 508 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W MRT4P33201 236 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W BCK2P33306 851 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YBR063CP38083 404 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W DBP8P38719 431 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W ARG2P40360 574 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YIL054WP40524 105 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W CSN12P47130 423 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YPL068CQ02749 293 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
YML039WYML039W SKM1Q12469 655 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W PCC1Q3E833 88 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W MER1P16523 270 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W SNF6P18888 332 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W RNR1P21524 888 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W VPH2P32341 215 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W FBP26P32604 452 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W ORC2P32833 620 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W LEU5P38702 357 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W COG3P40094 801 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W RMD8P43620 662 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W RAI1P53063 387 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W SPP2Q02521 185 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W MMT1Q03218 510 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W RPN4Q03465 531 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YMR160WQ03823 816 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YML096WQ04489 525 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W RMD5Q12508 421 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W PHO5P00635 467 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W MTC2P34246 357 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W HXT7P39004 570 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W IMA5P40884 581 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W RRN7P40992 514 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W VNX1P42839 908 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YJL043WP47053 257 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
YML039WYML039W ABM1P47146 123 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W LYS20P48570 428 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W SKP1P52286 194 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YGR016WP53209 190 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W GTR2P53290 341 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W SWS2P53937 143 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YPL107WQ02873 248 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W HPF1Q05164 967 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W RTT103Q05543 409 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W RSB1Q08417 382 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W TRM8Q12009 286 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W COX4P04037 155 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W DAL2P25335 343 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W IMG1P25626 169 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W RPT1P33299 467 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W VBA2P38358 474 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W DLD3P39976 496 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W JEM1P40358 645 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W REE1P40893 198 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W GNP1P48813 663 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W COS10P52924 374 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W IBD2P53892 351 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W GCR2Q01722 534 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W KIN4Q01919 800 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W ACL4Q03771 387 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YDR344CQ05510 147 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W CDC73Q06697 393 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W YAP7Q08182 245 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W GLO4Q12320 285 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W AVL9Q12500 764 aa2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YML039WYML039W MATALPHA2P0CY08 210 aa2.55□□□□□ -2
YML039WYML039W HMLALPHA2P0CY09 210 aa2.55□□□□□ -2
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