RNA–Protein interactions for RNA: YKL146W

AVT3, Transcript of Vacuolar transporter, yeast

Gene AVT3, Length 2,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT3	YKL146W	YNL140C	P53910	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	MMT1	Q03218	510 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	GRX3	Q03835	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	SPC2	Q04969	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	THI73	Q07904	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	RUP1	Q12242	671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	JLP1	Q12358	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	FUN30	P31380	1131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	TFC1	P32367	649 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	NGG1	P32494	702 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	ATO2	P32907	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	MRPL17	P36528	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	FTH1	P38310	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	MID1	P41821	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	NUP85	P46673	744 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	BNA1	P47096	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	GET1	P53192	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	MPS1	P54199	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	BSC2	Q05611	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	ASA1	Q06822	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	GRC3	Q07845	632 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	GAL1	P04385	528 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	ARG3	P05150	338 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	TOP3	P13099	656 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	ROT2	P38138	954 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	VNX1	P42839	908 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	FMP32	P43557	207 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	MET12	P46151	657 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	YJR115W	P47152	169 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	KXD1	P53158	218 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	SGF73	P53165	657 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	YGR016W	P53209	190 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	ROT1	Q03691	256 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	AGE1	Q04412	482 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	ISU2	Q12056	156 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	SUL2	Q12325	893 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	GPR1	Q12361	961 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT3	YKL146W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	COX3	P00420	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	ARG81	P05085	880 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	MRP13	P12686	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	RED1	P14291	827 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	HCM1	P25364	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	TRX3	P25372	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	SRX1	P36077	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	BET3	P36149	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	COS111	P38308	924 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	TDP1	P38319	544 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	BEM4	P39011	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	MRPS18	P42847	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	YFR020W	P43600	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	AIM22	P47051	409 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	GPI1	P53306	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	GMC2	Q06201	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	PSR1	Q07800	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	NMD4	Q12129	218 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	MDM35	O60200	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	MSS18	P08593	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	GLG1	P36143	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	CBP4	P37267	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	ATG7	P38862	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	GGC1	P38988	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	FMP33	P46998	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	KEL2	P50090	882 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	GOR1	P53839	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	YNL033W	P53964	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	YNL019C	P53975	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT3	YKL146W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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