RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	ZIM17	P42844	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	YGL138C	P53122	345 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	DON1	Q05610	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	DAP1	Q12091	152 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	VAM3	Q12241	283 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SEC63	P14906	663 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	TFB1	P32776	642 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	PXA2	P34230	853 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	VHC1	P38329	1120 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	URB2	P47108	1174 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SKO1	Q02100	647 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	MDM30	Q05930	598 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	URA4	P20051	364 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	GEX1	P25596	615 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	KRE2	P27809	442 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	BEM1	P29366	551 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	ATS1	P31386	333 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SIN4	P32259	974 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	HIR2	P32480	875 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	PTR2	P32901	601 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	CBP4	P37267	147 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SLM4	P38247	162 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	GWT1	P47026	490 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	COS5	P47187	383 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	ARK1	P53974	638 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	IRC15	Q02733	499 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	GRS2	Q06817	618 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	COS7	Q07788	383 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
RPC17	YJL011C	EXO70	P19658	623 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	CPR2	P23285	205 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	NDC1	P32500	655 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	GYP6	P32806	458 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	RFC3	P38629	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	HAT2	P39984	401 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	YJL070C	P40361	888 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	RTT101	P47050	842 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	ACL4	Q03771	387 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	MMR1	Q06324	491 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	VPS74	Q06385	345 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	CLN1	P20437	546 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	REC114	P32841	428 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	GCD10	P41814	478 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	TRS85	P46944	698 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SPC110	P32380	944 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	FRE2	P36033	711 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	YCR041W	P37265	110 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SER3	P40054	469 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	RPR2	P40571	144 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SAS2	P40963	338 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	ELP2	P42935	788 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	ECM27	P47144	725 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	CIK1	Q01649	594 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	HSP31	Q04432	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	HIP1	P06775	603 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	RHB1	P25378	209 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	BRF1	P29056	596 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	SHO1	P40073	367 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	ALG8	P40351	577 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	PCP1	P53259	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	DSL1	P53847	754 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	DCS1	Q06151	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	NDD1	Q08887	554 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	AYT1	Q12226	474 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPC17	YJL011C	HEM2	P05373	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	ECM25	P32525	599 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	PMU1	P36069	295 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPC17	YJL011C	LCB2	P40970	561 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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