RNA–Protein interactions for RNA: YHR109W

CTM1, Transcript of Cytochrome c lysine methyltransferase, yeast

Gene CTM1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTM1	YHR109W	SEC63	P14906	663 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	TYR1	P20049	452 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	HOT13	P36078	116 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PIB2	P53191	635 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SOL4	P53315	255 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SWF1	Q04629	336 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	DIC1	Q06143	298 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	POS5	Q06892	414 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SOR2	Q07786	357 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	HER1	Q12276	1246 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RRI1	Q12468	440 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	NUP100	Q02629	959 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	ARP10	Q04549	284 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RKM5	Q12367	367 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	ALG1	P16661	449 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	ADY2	P25613	283 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PCH2	P38126	564 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RFC3	P38629	340 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	LAG1	P38703	411 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	GPI16	P38875	610 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	MNL1	P38888	796 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SAS2	P40963	338 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	MCP2	Q06567	569 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SUC2	P00724	532 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PPQ1	P32945	549 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YER130C	P39959	443 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	NMD5	P46970	1048 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YJR154W	P47181	346 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
CTM1	YHR109W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PHO92	Q06390	306 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SSK1	Q07084	712 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	INO80	P53115	1489 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PHO91	P27514	894 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	COQ3	P27680	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PPZ2	P33329	710 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SRB2	P34162	210 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RRN10	P38204	145 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	LEU5	P38702	357 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PHO90	P39535	881 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RTT105	P40063	208 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	ELP2	P42935	788 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YFH1	Q07540	174 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	FLO5	P38894	1075 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YNL234W	P53857	426 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RHO4	Q00246	291 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SMA1	Q02651	245 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	VTC3	Q02725	835 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	EKI1	Q03764	534 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	HSP31	Q04432	237 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YOR012W	Q12351	137 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SFG1	Q12507	346 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SCEI	P03882	235 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	ERG11	P10614	530 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	SNC1	P31109	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	FLO10	P36170	1169 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	EFM2	P38347	419 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PHO86	P46956	311 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	VPS25	P47142	202 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	EFM3	P47163	339 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	HST1	P53685	503 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	MLH2	Q07980	695 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	NRT1	Q08485	598 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PNS1	Q12412	539 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YSC83	P32792	385 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	PDR3	P33200	976 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	RIB7	P33312	244 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	MSG5	P38590	489 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	STP2	P38704	541 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	STN1	P38960	494 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	TRS85	P46944	698 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTM1	YHR109W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.2 ms