RNA–Protein interactions for RNA: YCL036W

GFD2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene GFD2, Length 1,701 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GFD2	YCL036W	TRX3	P25372	127 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	NTG1	P31378	399 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SPC34	P36131	295 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SIC1	P38634	284 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	NDE1	P40215	560 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	MFG1	Q07684	458 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SPC42	P36094	363 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	CBP4	P37267	147 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	GDH3	P39708	457 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	MUP1	P50276	574 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ATG17	Q06410	417 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	VPS68	Q12016	184 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YLL054C	Q12244	843 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	MHF2	Q3E829	80 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	CLB3	P24870	427 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	UBC8	P28263	218 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	TFB1	P32776	642 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YJL070C	P40361	888 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YRB2	P40517	327 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	COS12	P53053	380 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	NMD4	Q12129	218 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	TIM9	O74700	87 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	CTR86	P25355	563 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	RIB1	P38066	345 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YBR285W	P38354	144 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	AZF1	P41696	914 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	BIR1	P47134	954 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YNR061C	P53747	219 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ROT1	Q03691	256 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	VPS74	Q06385	345 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	PPZ1	P26570	692 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SPO23	P33757	523 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	CCT6	P39079	546 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.66	□□□□□ -0.54	not detected
GFD2	YCL036W	PMT4	P46971	762 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	NDL1	Q06568	189 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	RCK1	P38622	512 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	GGC1	P38988	300 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	TY4A-J	P47023	414 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ATH1	P48016	1211 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	KXD1	P53158	218 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SGF73	P53165	657 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	RAD30	Q04049	632 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ARR1	Q06596	294 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	NSE1	Q07913	336 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	THP1	Q08231	455 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YPR096C	O13587	100 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	FUS1	P11710	512 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	LAS21	P40367	830 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	BIO3	P50277	480 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	SNO2	P53823	222 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	GYP1	Q08484	637 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	RSA1	Q08932	381 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	HAL9	Q12180	1030 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	MDM12	Q92328	271 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GFD2	YCL036W	INH1	P01097	85 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	CNA1	P23287	553 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	YEL020C	P39994	560 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	SMP3	Q04174	516 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	COS7	Q07788	383 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	OPI10	Q08202	246 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	VIK1	Q12045	647 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	GAL3	P13045	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	FAR1	P21268	830 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GFD2	YCL036W	YKL151C	P36059	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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